中枢神经系统淋巴瘤分子预后数据集（ALYCE-molecular）

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03859544

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：中枢神经系统淋巴瘤。中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）是一种弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL），预后特别差（中位生存期小于3年）。其在生物学上仍知之甚少，很大程度上是因为其罕见（法国每年300例）以及难以获得足够质量和数量的材料。然而，据推测其病理生理学具有特殊性，因为它们专门在免疫豁免区发展，并呈现一些特征性分子异常（例如MYD88或TBL1XR1突变）。已建立了一个包含74例PCNSL的临床注释采集库，除石蜡固定包埋材料外，还可获得冷冻材料（ALYCE队列）。所有患者均已获得知情同意。对该队列的比较基因组杂交芯片分析已揭示与不良预后相关的异常（未发表数据）。

本研究的目的是通过对一组在DLBCL和PCNSL中反复突变的96个基因进行测序，以及通过逆转录酶-多重连接依赖性探针扩增（RT-MLPA）技术对原始细胞进行分子测定，来完成这一分析。遗传、分子和转录组数据的整合可能定义预后标志物，并为PCNSL的转化研究开辟前景。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。