滤泡性淋巴瘤或反应性增生淋巴结数据集
该数据集来自 ebi.ac.uk,包含滤泡性淋巴瘤与反应性淋巴结的基因表达谱比较数据,共涉及 8 例滤泡性淋巴瘤和 5 例反应性淋巴结样本

基本信息
资源简介
滤泡性淋巴瘤或反应性增生淋巴结数据集
该数据集英文名为 Lymph nodes with follicular lymphoma or reactive hyperplasia,聚焦于滤泡性淋巴瘤与反应性淋巴结之间的基因表达谱比较,属于肿瘤领域中淋巴瘤方向的数据资源,来源为 ebi.ac.uk。数据集围绕转录组层面的表达谱检测展开,采用微阵列(transcription profiling by array)技术路线,物种为人(Homo sapiens)。整体设计以两类淋巴结样本的对照比较为核心,共涉及 8 例滤泡性淋巴瘤样本与 5 例反应性淋巴结样本,可用于观察两种病理状态之间基因表达模式的差异。该数据集为研究滤泡性淋巴瘤的分子特征及其与反应性增生性病变的区分提供了可用的表达谱材料,适合作为淋巴瘤转录组分析与方法学验证的参考数据。
【数据集背景】
滤泡性淋巴瘤是一种起源于生发中心 B 细胞的淋巴系统肿瘤,而反应性淋巴结增生则是淋巴结在免疫刺激下出现的非肿瘤性改变,两者在组织形态学上有时存在鉴别难点。从分子层面比较二者的基因表达谱,有助于揭示肿瘤性病变与反应性增生之间的转录组差异。该数据集正是围绕这一比较目的而建立,其源站描述明确指出,数据集用于比较滤泡性淋巴瘤与反应性淋巴结的基因表达谱,纳入 8 例滤泡性淋巴瘤和 5 例反应性淋巴结。数据集在分类上归入肿瘤 / 淋巴瘤方向,主题标签为转录组微阵列 profiling 与人类物种,体现了其在淋巴瘤分子研究中的定位。
【数据内容】
数据集的内容主体是两类淋巴结样本的基因表达谱数据:8 例滤泡性淋巴瘤病例与 5 例反应性淋巴结病例。数据以转录组微阵列检测结果的形式组织,反映各样本在基因表达水平上的整体模式。数据集的英文名称直接点明了样本类型与疾病状态,即带有滤泡性淋巴瘤或反应性增生的淋巴结。除样本例数与比较设计外,源站未提供关于具体基因数量、探针平台型号、表达值分布或临床注释等更细化的内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述说明其内容为滤泡性淋巴瘤与反应性淋巴结基因表达谱的比较,样本构成包括 8 例滤泡性淋巴瘤与 5 例反应性淋巴结。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及具体的实验操作流程,源站未提供。
【适用场景】
基于其比较设计,该数据集适用于淋巴瘤转录组研究中的差异表达分析、两类淋巴结病变的分子分型探索,以及作为微阵列数据分析流程的示例数据。研究者可将其用于检验分类方法在滤泡性淋巴瘤与反应性淋巴结之间的区分能力,或用于基因表达谱比较的方法学练习。关于该数据集在临床诊断或预后判断中的具体应用价值,源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时,可围绕 8 例滤泡性淋巴瘤与 5 例反应性淋巴结的分组开展组间表达谱比较。具体的预处理步骤、归一化方法、统计检验策略以及分析软件选择,源站未提供,需使用者依据数据实际格式自行确定。
【质量与限制】
该数据集的样本规模为 8 例滤泡性淋巴瘤与 5 例反应性淋巴结,样本量相对有限,可能影响统计推断的稳健性。关于数据质量评估、批次效应、样本纳入排除标准以及平台技术参数等信息,源站未提供。使用者在解释结果时应考虑样本量与设计信息不完整带来的局限。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-14214
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Jack Zhu; Keith Killian; Paul Meltzer (2011). Lymph nodes with follicular lymphoma or reactive hyperplasia [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-14214
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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