CD30阳性淋巴增殖性疾病中的JAK与STAT改变
该数据集来自omicsdi.org，聚焦CD30阳性淋巴增殖性疾病（LPD），包括淋巴瘤样丘疹病（LyP）和皮肤间变性大T细胞淋巴瘤（cALCL）
基本信息
资源简介
CD30阳性淋巴增殖性疾病中的JAK与STAT改变
JAK and STAT alterations in CD30 positive LPD 是一个聚焦CD30阳性淋巴增殖性疾病（LPD）的基因组学数据集，来源于omicsdi.org，在分类上归属于肿瘤 / 淋巴瘤方向。该数据集所对应的研究关注淋巴瘤样丘疹病（LyP）与皮肤间变性大T细胞淋巴瘤（cALCL）这两类皮肤CD30阳性淋巴增殖性疾病的分子发病机制。源站描述指出，研究者在12例特征明确的患者队列中开展了全面的下一代测序，并针对LyP肿瘤细胞含量低的特点采用了靶向测序策略。该数据集以Genomics为主题标签，其核心价值在于呈现与CD30阳性LPD相关的JAK与STAT改变信息，为理解这类疾病的分子基础提供数据支撑。
【数据集背景】
皮肤CD30阳性淋巴增殖性疾病（LPD）包含两种不同的疾病实体，即淋巴瘤样丘疹病（LyP）和皮肤间变性大T细胞淋巴瘤（cALCL）。LyP表现为良性淋巴增殖，伴可自行消退的丘疹；cALCL则表现为单发或多发皮肤肿瘤，播散倾向较低。源站描述强调，这两类疾病的分子发病机制此前在很大程度上仍不清楚，因此研究者针对一个特征明确的12例患者队列开展了全面的下一代测序，以期阐明其分子发病基础。该数据集正是在这一研究背景下产生，围绕JAK与STAT相关改变组织数据，服务于CD30阳性LPD分子病理机制的研究需求。
【数据内容】
该数据集的主题标签为Genomics，属于肿瘤 / 淋巴瘤分类下的基因组学数据。源站描述提及，研究采用靶向测序技术，结合基于杂交捕获的DNA文库制备方法，并使用锚定多重PCR富集试剂盒来识别融合转录本。研究的主要发现是，在50%的LPD病例中检测到提示组成性激活的遗传事件（源站描述在此处截断，未提供该遗传事件的完整表述）。数据集名称明确指向JAK与STAT改变，结合源站描述中关于遗传事件的发现，可以认为该数据集承载的是与JAK/STAT通路相关的基因组变异信息。关于具体基因位点、变异类型分布、样本层面的详细注释等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为omicsdi.org。源站描述说明，研究在一个特征明确的12例患者队列中开展全面下一代测序，样本来自CD30阳性LPD患者。为应对LyP肿瘤细胞含量低的问题，研究者选择了靶向测序技术路线，DNA文库制备采用基于杂交捕获的方法，融合转录本的识别则借助锚定多重PCR富集试剂盒。关于样本采集的具体部位、时间跨度、伦理审批信息以及数据产生的时间等，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与内容，该数据集适用于CD30阳性淋巴增殖性疾病分子机制相关的研究场景，例如探讨LyP与cALCL中JAK/STAT通路改变的研究、融合转录本识别方法的应用研究，以及针对低肿瘤细胞含量样本的靶向测序策略评估。其基因组学属性也使其可用于淋巴瘤分类与分子病理方向的比较分析。关于该数据集是否已被用于特定类型的下游分析或临床转化研究，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式、分析流程或配套工具等信息。
【质量与限制】
源站描述显示，研究队列为12例患者，样本量相对有限；同时LyP本身肿瘤细胞含量低，研究者因此采用靶向测序与富集策略加以应对，这提示数据在检测灵敏度与覆盖范围上存在方法学层面的考量。源站描述在主要发现处截断，未给出遗传事件的完整结论。关于数据集的质控指标、批次信息、数据完整性评估等，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001004181
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
皮肤CD30阳性淋巴增殖性疾病(LPD)组包括两种不同的疾病实体，即淋巴瘤样丘疹病(LyP)和皮肤间变性大T细胞淋巴瘤(cALCL)。LyP是一种良性淋巴增殖性疾病，表现为可自行消退的丘疹，而cALCL则表现为单发或多发皮肤肿瘤，播散倾向较低。为阐明这些疾病实体迄今 largely 未知的分子发病机制，我们在一个特征明确的12例患者队列中进行了全面的下一代测序。考虑到LyP的肿瘤细胞含量较低，我们采用了靶向测序技术，结合基于杂交捕获的DNA文库制备方法，并使用锚定多重PCR富集试剂盒来鉴定融合转录本。作为主要发现，我们在50%的LPD中检测到提示这些疾病实体中JAK-STAT通路组成性激活的遗传学事件。所鉴定的分子异常包括致病性STAT突变或包含JAK效应结构域的致癌性融合转录本。
关于LyP，我们分别是首次在这一特定病种中证实此类基因异常的研究者。在JAK-STAT信号通路中检测到这些趋同的异常，揭示了LyP与cALCL之间共享的LPD内淋巴瘤发生的共同潜在驱动机制。此外，这些致癌改变的存在为开发新的个体化治疗策略铺平了道路。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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