新诊断弥漫性大B细胞淋巴瘤整合分析数据集
该数据集来自ebi.ac.uk，聚焦新诊断的原发性弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）。研究利用HD-SNP阵列和GISTIC算法刻画了180例原发DLBCL及53例正常DNA样本的复发性拷贝数变异（CNA），并对其中169例DLBCL进行了RNA表达谱分析（78例使用Affymetrix U133A
基本信息
资源简介
新诊断弥漫性大B细胞淋巴瘤整合分析数据集
Integrative Analysis of a series of newly diagnosed Diffuse Large B-cell Lymphomas (DLBCLs)
该数据集来自ebi.ac.uk，聚焦新诊断的原发性弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）。研究利用HD-SNP阵列和GISTIC算法刻画了180例原发DLBCL及53例正常DNA样本的复发性拷贝数变异（CNA），并对其中169例DLBCL进行了RNA表达谱分析（78例使用Affymetrix U133A+B，91例使用另一平台），进而整合基因表达与拷贝数数据评估转录丰度与特定CNA的关联。数据涵盖转录组谱和比较基因组杂交信息，可用于DLBCL分子分型、CNA与表达关联分析等研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）是一种在临床和生物学上具有异质性的疾病。我们利用HD-SNP阵列和GISTIC算法，在一大批原发性DLBCL中刻画了复发性拷贝数变异（CNA）。通过对大多数原发性DLBCL获取RNA谱，并将基因表达谱与拷贝数数据整合，我们评估了转录丰度与特定CNA存在之间的关联。根据IRB批准的方案，从新诊断且既往未经治疗的原发性DLBCL的冷冻活检标本中提取高分子量DNA和总RNA。DLBCL诊断及>80%的肿瘤累及由专家血液学家确认。180例原发性DLBCL和53例正常DNA样本在Affymetrix SNP array 6.0上进行了分析。这些原发性DLBCL中有169例进行了RNA谱分析，其中78例使用Affymetrix U133A+B，91例使用
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-34171
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源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-34171
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Bjoern Chapuy; B Chapuy; S Monti; M Shipp (2012). Integrative Analysis of a series of newly diagnosed Diffuse Large B-cell Lymphomas (DLBCLs) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-34171
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