IDR idr0158-radtke-lymphoma 淋巴瘤细胞组织成像数据集(experimentA)
主题标签:淋巴瘤、肿瘤、细胞成像、组织成像、IDR、OME/EMBL-EBI。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖淋巴瘤。

基本信息
资源简介
IDR idr0158-radtke-lymphoma 淋巴瘤细胞组织成像数据集(experimentA)
IDR idr0158-radtke-lymphoma(experimentA)是 Image Data Resource(IDR)中收录的一项公开肿瘤影像数据集,主题聚焦于淋巴瘤。该数据集归属于肿瘤/淋巴瘤分类,由 OME/EMBL-EBI 维护的 IDR 平台提供,源站将其描述为一项经过策展的细胞/组织成像研究,实验编号为 experimentA,共包含 6 幅图像。数据集以细胞成像和组织成像为核心内容方向,面向淋巴瘤相关研究场景开放获取。整体而言,该数据集规模精简,定位明确,适合作为淋巴瘤细胞与组织形态观察、影像方法验证及教学演示的参考资源,也可作为 IDR 平台上肿瘤影像数据检索与复用的入口之一。
【数据集背景】
该数据集来源于 IDR(Image Data Resource),这是由 OME 与 EMBL-EBI 共同维护的公开影像数据资源平台,专门收录经过策展的细胞与组织成像研究。数据集英文名称为 IDR idr0158-radtke-lymphoma,实验标识为 experimentA,属于 IDR 研究编号 idr0158-radtke-lymphoma 下的一个实验单元。从主题上看,该研究围绕淋巴瘤展开,归入肿瘤领域下的淋巴瘤分类,体现了 IDR 对肿瘤相关显微成像研究的收录方向。源站将其定位为 curated cell/tissue imaging study,即经过整理与注释的细胞/组织成像研究,说明数据在进入平台时已具备一定的组织结构和元数据描述。
【数据内容】
该实验共包含 6 幅图像,内容主题涵盖淋巴瘤相关的细胞成像与组织成像。数据集的主题标签包括淋巴瘤、肿瘤、细胞成像、组织成像、IDR 以及 OME/EMBL-EBI,这些标签概括了数据的内容领域与来源平台。图像的具体模态、染色方式、分辨率、通道数量、样本类型细分以及单幅图像的尺寸等信息,源站未提供。除图像数量外,该实验是否附带分割标注、特征表格或其他衍生数据,源站未提供。
【采集与来源】
数据集的来源站为 idr.openmicroscopy.org,即 IDR 的公开访问站点。源站描述表明,该数据属于 Image Data Resource 收录的策展型细胞/组织成像研究,由 OME/EMBL-EBI 体系维护。研究名称中的 radtke-lymphoma 指向该研究的标识性命名,但关于样本采集机构、实验负责人、样本供体信息、成像仪器型号及采集参数等具体细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与内容特征,该数据集可服务于淋巴瘤相关的细胞与组织形态学观察,适合用于肿瘤影像分析方法的初步验证、成像流程的演示与教学,以及作为 IDR 平台肿瘤类数据检索与比较的对象。由于数据规模为 6 幅图像,其更适合定性观察与小规模示例性分析,而非大规模统计建模。涉及具体研究设计或临床结论的用途,源站未提供相应支持信息。
【使用方法】
该数据集可通过 IDR 公开站点 idr.openmicroscopy.org 访问,用户可在平台上按研究编号 idr0158-radtke-lymphoma 及实验标识 experimentA 定位该实验。IDR 平台通常提供基于 Web 的图像浏览与元数据查看功能,具体到本实验的下载格式、导出选项、API 访问方式及配套分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集经过 IDR 策展流程收录,具备平台层面的组织与描述框架。其显著限制在于图像数量仅为 6 幅,样本规模有限,难以支撑需要大样本量的分析任务。关于图像质量评估、批次效应、注释完整性以及是否存在缺失或排除样本等信息,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。使用前建议在 IDR 平台上查阅该研究条目所附的官方说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-3001
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDR study idr0158-radtke-lymphoma. Experiment: experimentA. Images: 6. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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