EBV LMP1和LMP2A驱动生发中心B细胞淋巴增殖性疾病小鼠模型

该数据集来自NCBI GEO,标题为EBV LMP1和LMP2A驱动生发中心B细胞淋巴增殖性疾病的小鼠模型,属于肿瘤/淋巴瘤分类

geo
浏览 2
基因组分类GPL1905710090
GSE93827: A Mouse Model of Epstein-Barr virus LMP1 and LMP2A Driven Germinal Center B-cell Lymphoproliferative Disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

EBV LMP1和LMP2A驱动生发中心B细胞淋巴增殖性疾病小鼠模型

A Mouse Model of Epstein-Barr virus LMP1 and LMP2A Driven Germinal Center B-cell Lymphoproliferative Disease

该数据集来自NCBI GEO,标题为EBV LMP1和LMP2A驱动生发中心B细胞淋巴增殖性疾病的小鼠模型,属于肿瘤/淋巴瘤分类。数据包含1个文件GSE93827_series_matrix.txt.gz,基于高通量测序表达谱,物种为小鼠(10090),平台为GPL19057。研究通过AICDA启动子驱动GFP或EBV潜伏膜蛋白LMP1和LMP2A表达的转基因小鼠,在T和NK细胞清除后观察LMP1/2A共表达导致的浆母细胞性淋巴瘤样细胞增殖。该数据可用于研究EBV膜癌蛋白对B细胞生长、存活和体内致病机制的影响(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 19 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Epstein-Barr病毒(EBV)是免疫抑制相关淋巴瘤的主要病因。EB驱动的淋巴增殖性疾病在高达20%的移植中发生并发症,且EBV是人类免疫缺陷病毒相关淋巴瘤的主要病因。尽管抗逆转录病毒治疗成功,EBV相关霍奇金淋巴瘤的发病率在HIV+个体中持续增加。为了深入了解EBV膜癌蛋白对B细胞生长、存活和体内发病机制的影响,我们生成了转基因小鼠模型,其中敲入小鼠在AICDA启动子控制下转基因表达对照GFP或EBV潜伏膜蛋白(LMP)1和2A。通过抗体混合物清除T和NK细胞后,LMP1和2A共表达驱动浆母细胞性淋巴瘤样细胞的爆发性生长,这些细胞在脾脏中增殖,导致严重的终末器官损伤和死亡。RNAseq分析识别

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL19057、10090。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE93827

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE93827

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Epstein-Barr病毒(EBV)是免疫抑制相关淋巴瘤的主要病因。EB驱动的淋巴增殖性疾病可使高达20%的移植病例复杂化,且EBV是人类免疫缺陷病毒相关淋巴瘤的主要病因。尽管抗逆转录病毒治疗成功,EBV相关霍奇金淋巴瘤在HIV阳性个体中的发病率仍持续上升。为深入了解EBV膜癌蛋白对B细胞生长、存活及体内致病机制的影响,我们构建了转基因小鼠模型,其中敲入小鼠在AICDA启动子控制下转基因表达对照GFP或EBV潜伏膜蛋白(LMP)1和2A。经抗体混合物清除T细胞和NK细胞后,LMP1和2A共表达驱动浆母细胞性淋巴瘤样细胞爆发性生长,这些细胞在脾脏中增殖,导致严重终末器官损伤和死亡。RNAseq分析鉴定了LMP1和2A对B细胞基因表达的全基因组影响,包括对趋化因子和细胞因子产生的显著影响。

尽管细胞表现出浆母细胞特征,LMP1和2A的共表达还诱导了混合的造血谱系标志物,这是霍奇金淋巴瘤一个已被充分描述但尚未完全理解的特征。总体而言,我们的结果揭示了EBV膜癌蛋白表达的协同效应,并强调了它们在免疫缺陷宿主淋巴增殖性疾病中的作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。