MicroRNA-28用于非霍奇金淋巴瘤治疗的数据集

数据基于高通量测序表达谱,涉及人类(9606)样本,平台为GPL16791。研究聚焦于miR-28在生发中心反应中的作用及其对非霍奇金淋巴瘤的治疗潜力,可用于探索miRNA表达模式与淋巴瘤治疗相关的预测分析(来源 NCBI)

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基因组预测GPL167919606
GSE81236: MicroRNA-28 replacement for non-Hodgkin lymphoma therapy

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

MicroRNA-28用于非霍奇金淋巴瘤治疗的数据集

GSE81236 是一个围绕微小 RNA-28(miR-28)与非霍奇金淋巴瘤治疗关系展开的表达谱数据集,源站标题为“MicroRNA-28 replacement for non-Hodgkin lymphoma therapy”。该数据集通过高通量测序获取表达谱信息,样本来自人类(分类编号 9606),测序平台为 GPL16791,整体归入肿瘤/淋巴瘤方向。源站说明指出,相关研究识别了 miR-28 在生发中心反应中的作用,并评估其用于非霍奇金淋巴瘤治疗的潜力。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE81236_series_matrix.txt.gz,作者为 Nahikari、Bartolomé-Izquierdo,发布时间为 May 09 201。该数据集适合用于考察 miRNA 表达模式与淋巴瘤治疗相关的预测性分析。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),标题聚焦于以微小 RNA-28 替代策略治疗非霍奇金淋巴瘤的可能性。源站描述表明,相关研究旨在阐明 miR-28 在生发中心反应中所扮演的角色,并进一步探讨其对非霍奇金淋巴瘤的治疗潜力。这一背景决定了数据集的核心主题是 miRNA 与淋巴瘤生物学及治疗干预之间的联系,而非泛化的肿瘤表达谱资源。数据集在分类上归入肿瘤/淋巴瘤,主题标签包含“Expression profiling by high throughput sequencing”,说明其技术路线为高通量测序表达谱分析。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE81236_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的表达谱矩阵文件。主题标签中列出了 GPL16791 平台与 9606(人类)物种信息,表明数据基于该平台对人类样本进行高通量测序表达谱检测。源站未提供矩阵内具体样本数量、分组设计、基因或 miRNA 条目数等细节。数据内容围绕 miR-28 在生发中心反应中的作用及其对非霍奇金淋巴瘤的治疗潜力展开,可用于观察 miRNA 表达模式。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Nahikari、Bartolomé-Izquierdo,发布时间为 May 09 201。源站描述强调研究识别了 miR-28 在生发中心反应中的作用及其治疗潜力。除上述信息外,源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批、测序试剂与仪器型号等具体采集细节。

【适用场景】

该数据集适用于探索 miRNA 表达模式与非霍奇金淋巴瘤治疗相关的预测分析,也可用于围绕生发中心反应中 miR-28 功能开展的表达谱层面研究。由于主题标签明确为高通量测序表达谱,其典型用途包括表达谱比较、miRNA 相关候选标志物探索等。源站未提供具体的分析案例、验证实验设计或临床转化应用细节。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE81236_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段含义或编码不一致导致后续分析偏差。源站未提供配套的分析脚本、标准化流程或注释文件说明。

【质量与限制】

数据集仅有 1 个文件,规模信息有限;源站未提供样本量、重复数、测序深度、质控指标等质量相关数据,因此无法据此评估数据质量水平。发布时间记为 May 09 201,年份信息不完整。使用时应以源站原始记录为准,并注意该数据集聚焦于 miR-28 与非霍奇金淋巴瘤这一特定主题,外推到其他疾病或 miRNA 时需谨慎。源站未提供其他限制说明。

【引用与许可】

源站未提供引用格式与许可条款信息。使用或再分发前应向来源站 ncbi.nlm.nih.gov 核实相关要求。作者信息为 Nahikari、Bartolomé-Izquierdo,可作为溯源参考。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE81236

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们的研究确定了mIR-28在生发中心反应中的作用及其治疗非霍奇金淋巴瘤的潜力

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