GSE70938:抑制miR-155靶点NIAM模拟miR-155在B细胞淋巴瘤中的促生长效应 [KM-H2]
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE70938,聚焦miR-155在B细胞淋巴瘤中的致癌机制。研究通过Argonaute 2 RNA免疫沉淀,在霍奇金淋巴瘤细胞抑制miR-155及伯基特淋巴瘤细胞异位表达miR-155的条件下鉴定靶基因,发现54个miR-155特异性靶基因并确认DET1、NI
![GSE70938: Inhibition of the miR-155 target NIAM phenocopies the growth promoting effect of miR-155 in B-cell lymphoma [KM-H2]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/168518.jpg)
基本信息
资源简介
GSE70938:抑制miR-155靶点NIAM模拟miR-155在B细胞淋巴瘤中的促生长效应 [KM-H2]
Inhibition of the miR-155 target NIAM phenocopies the growth promoting effect of miR-155 in B-cell lymphoma [KM-H2]
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE70938,聚焦miR-155在B细胞淋巴瘤中的致癌机制。研究通过Argonaute 2 RNA免疫沉淀,在霍奇金淋巴瘤细胞抑制miR-155及伯基特淋巴瘤细胞异位表达miR-155的条件下鉴定靶基因,发现54个miR-155特异性靶基因并确认DET1、NIAM、TRIM32、HOMEZ、PSIP1和JARID2受miR-155靶向调控。数据包含1个表达谱芯片文件,可用于B细胞淋巴瘤中miR-155靶基因的筛选与验证研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 15 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):多项研究表明miR-155在B细胞淋巴瘤的发病机制中具有重要作用。除伯基特淋巴瘤(BL)外,大多数B细胞淋巴瘤中确实观察到miR-155水平高度升高。然而,miR-155在B细胞淋巴瘤中发挥致癌作用的分子机制尚不清楚。为鉴定与B细胞淋巴瘤相关的miR-155靶点,我们在抑制miR-155的霍奇金淋巴瘤(HL)细胞中以及异位表达miR-155的BL细胞中进行了Argonaute 2的RNA免疫沉淀。我们在BL细胞中鉴定了54个miR-155特异性靶基因,并确认了miR-155对DET1、NIAM、TRIM32、HOMEZ、PSIP1和JARID2的靶向作用。其中五个靶点也受HL细胞中内源性miR-155的调控。miR-155的过表达和新型miR-155靶基因NIAM的表达抑制均增加了增殖
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL6480、9606。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE70938
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 23 201,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
多项研究表明,miR-155在B细胞淋巴瘤的发病机制中发挥重要作用。确实,在大多数B细胞淋巴瘤中观察到miR-155水平高度升高,但伯基特淋巴瘤(BL)除外。然而,miR-155在B细胞淋巴瘤中发挥致癌作用的分子机制尚不清楚。为鉴定与B细胞淋巴瘤相关的miR-155靶点,我们在抑制miR-155的霍奇金淋巴瘤(HL)细胞中以及异位表达miR-155的BL细胞中进行了Argonaute 2的RNA免疫沉淀。我们在BL细胞中鉴定了54个miR-155特异性靶基因,并证实了miR-155对DET1、NIAM、TRIM32、HOMEZ、PSIP1和JARID2的靶向作用。其中五个靶点同样受HL细胞中内源性miR-155的调控。过表达miR-155和抑制新型miR-155靶基因NIAM的表达均增加了BL细胞的增殖。在原发性B细胞淋巴瘤中,NIAM阳性病例的miR-155水平显著低于NIAM阴性病例,提示NIAM在原发性B细胞淋巴瘤中也受miR-155调控。
因此,我们的数据表明miR-155在B细胞淋巴瘤中具有致癌作用,这一作用涉及靶向抑癌基因NIAM。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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