套细胞淋巴瘤对照与TP53敲低细胞系中核输出抑制剂对基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE70479

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

TP53野生型细胞系JVM2代表套细胞淋巴瘤(MCL)，经转导后创建了对照组或TP53敲低(KD)形式。随后，这些细胞要么未经处理，要么用KPT-185处理，KPT-185是XPO1的选择性核输出抑制剂(SINE)，用于基因表达谱分析(GEP)。与KPT-185对两种形式具有同等毒性的观察结果一致，KPT-185处理引起的大部分基因表达变化在两种形式中相似，尽管已知TP53是XPO1的货物蛋白之一。GEP显示参与增殖的基因下调，这与细胞周期分析的结果一致，并得到Western blot结果的支持。定量蛋白质组学揭示核糖体生物发生的抑制是KPT-185的主要不依赖TP53的效应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。