GSE69053:将基因组学转化至临床:区分Burkitt与弥漫大B细胞淋巴瘤

GSE69053 是一个来自 NCBI GEO 的 SuperSeries 数据集,主题为将基因组学转化至临床,用于区分 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL84329606
GSE69053: Transferring genomics to the clinic: distinguishing Burkitt and Diffuse large B-cell lymphoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

GSE69053:将基因组学转化至临床:区分Burkitt与弥漫大B细胞淋巴瘤

GSE69053 是一个来自 NCBI GEO 的 SuperSeries 数据集,英文全称为“Transferring genomics to the clinic: distinguishing Burkitt and Diffuse large B-cell lymphoma”,中文可理解为“将基因组学转化至临床:区分 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤”。该数据集归入肿瘤 / 淋巴瘤分类,主题标签涉及表达谱芯片分析,物种标识为 9606(人类),平台标识为 GPL8432。数据集由作者 Chulin、Sha 发布,发布时间为 May 19 201(源站所记年份不完整)。数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE69053_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集面向淋巴瘤分子分型这一临床转化问题,为区分 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤提供基因表达层面的数据资源。

【数据集背景】

该数据集源站标题为“Transferring genomics to the clinic: distinguishing Burkitt and Diffuse large B-cell lymphoma”,其核心命题是将基因组学研究成果向临床实践转化,用于区分 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤这两类 B 细胞来源的淋巴瘤。源站将其登记为 SuperSeries,源站描述说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成。数据集被本站归入肿瘤 / 淋巴瘤分类,主题标签包含“Expression profiling by array”,表明其数据属于基于芯片的表达谱分析类型。

【数据内容】

数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE69053_series_matrix.txt.gz,即一个 GZIP 压缩的系列矩阵文件。主题标签中包含平台标识 GPL8432 与物种标识 9606,说明数据对应人类样本的芯片表达谱。除上述文件与标签信息外,源站未提供关于样本数量、分组设计、基因数量或具体表达矩阵字段的进一步说明。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。源站描述指出该 SuperSeries 由所列 SubSeries 组成,说明其数据组织方式为多个子系列汇总而成。作者为 Chulin、Sha,发布时间为 May 19 201。关于样本采集地点、伦理审批、实验平台的具体型号与实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤鉴别诊断的基因表达谱研究,可用于探索两类淋巴瘤在表达层面的差异,并服务于将基因组学信息向临床分型转化的研究主题。由于主题标签标明为芯片表达谱分析,其典型用途包括表达谱数据的读取、整理与二次分析。具体的临床验证结论或诊断性能指标,源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE69053_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包格式,需按对应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。关于矩阵文件内部的具体字段含义与注释信息,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,且源站描述较为简略,仅说明其为由 SubSeries 组成的 SuperSeries。样本量、数据完整性、批次效应、归一化方法等质量相关信息,源站未提供。发布时间记录为 May 19 201,年份信息不完整,使用时需注意核对。由于缺乏 SubSeries 的明细说明,单独使用该系列矩阵文件时的覆盖范围需以源站实际内容为准。

【引用与许可】

数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),作者为 Chulin、Sha。关于该数据集的具体许可条款与推荐引用格式,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE69053

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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