GSE69053:将基因组学转化至临床:区分Burkitt与弥漫大B细胞淋巴瘤
GSE69053 是一个来自 NCBI GEO 的 SuperSeries 数据集,主题为将基因组学转化至临床,用于区分 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤

基本信息
资源简介
GSE69053:将基因组学转化至临床:区分Burkitt与弥漫大B细胞淋巴瘤
GSE69053 是一个来自 NCBI GEO 的 SuperSeries 数据集,英文全称为“Transferring genomics to the clinic: distinguishing Burkitt and Diffuse large B-cell lymphoma”,中文可理解为“将基因组学转化至临床:区分 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤”。该数据集归入肿瘤 / 淋巴瘤分类,主题标签涉及表达谱芯片分析,物种标识为 9606(人类),平台标识为 GPL8432。数据集由作者 Chulin、Sha 发布,发布时间为 May 19 201(源站所记年份不完整)。数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE69053_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集面向淋巴瘤分子分型这一临床转化问题,为区分 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤提供基因表达层面的数据资源。
【数据集背景】
该数据集源站标题为“Transferring genomics to the clinic: distinguishing Burkitt and Diffuse large B-cell lymphoma”,其核心命题是将基因组学研究成果向临床实践转化,用于区分 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤这两类 B 细胞来源的淋巴瘤。源站将其登记为 SuperSeries,源站描述说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成。数据集被本站归入肿瘤 / 淋巴瘤分类,主题标签包含“Expression profiling by array”,表明其数据属于基于芯片的表达谱分析类型。
【数据内容】
数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE69053_series_matrix.txt.gz,即一个 GZIP 压缩的系列矩阵文件。主题标签中包含平台标识 GPL8432 与物种标识 9606,说明数据对应人类样本的芯片表达谱。除上述文件与标签信息外,源站未提供关于样本数量、分组设计、基因数量或具体表达矩阵字段的进一步说明。
【采集与来源】
数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。源站描述指出该 SuperSeries 由所列 SubSeries 组成,说明其数据组织方式为多个子系列汇总而成。作者为 Chulin、Sha,发布时间为 May 19 201。关于样本采集地点、伦理审批、实验平台的具体型号与实验流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕 Burkitt 淋巴瘤与弥漫大 B 细胞淋巴瘤鉴别诊断的基因表达谱研究,可用于探索两类淋巴瘤在表达层面的差异,并服务于将基因组学信息向临床分型转化的研究主题。由于主题标签标明为芯片表达谱分析,其典型用途包括表达谱数据的读取、整理与二次分析。具体的临床验证结论或诊断性能指标,源站未提供。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE69053_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包格式,需按对应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。关于矩阵文件内部的具体字段含义与注释信息,源站未提供。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,且源站描述较为简略,仅说明其为由 SubSeries 组成的 SuperSeries。样本量、数据完整性、批次效应、归一化方法等质量相关信息,源站未提供。发布时间记录为 May 19 201,年份信息不完整,使用时需注意核对。由于缺乏 SubSeries 的明细说明,单独使用该系列矩阵文件时的覆盖范围需以源站实际内容为准。
【引用与许可】
数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),作者为 Chulin、Sha。关于该数据集的具体许可条款与推荐引用格式,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE69053
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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