将基因组学转化至临床:区分Burkitt与弥漫大B细胞淋巴瘤(v4)
该数据集来自NCBI GEO,包含156例新患者FFPE活检组织的RNA基因表达谱数据,使用Illumina DASL v4平台检测,另含71例v3平台重复样本和12例来自GSE32918的重复样本

基本信息
资源简介
将基因组学转化至临床:区分Burkitt与弥漫大B细胞淋巴瘤(v4)
Transferring genomics to the clinic: distinguishing Burkitt and Diffuse large B-cell lymphoma (v4)
该数据集来自NCBI GEO,包含156例新患者FFPE活检组织的RNA基因表达谱数据,使用Illumina DASL v4平台检测,另含71例v3平台重复样本和12例来自GSE32918的重复样本。数据用于通过文章提出的分子分类器将患者分为Burkitt淋巴瘤(BL)和弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL),可支撑淋巴瘤分子分型相关的分类建模与验证研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 19 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对156例新患者福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)活检组织提取的RNA使用Illumina DASL第4版平台进行基因表达谱检测,另含71例来自第3版平台的重复样本和12例来自GSE32918的重复样本。随后根据文章提出的分子分类器将患者分为BL和DLBCL。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL14951、9606。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE69051
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 24 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
对156例新患者的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)活检组织提取的RNA,使用Illumina DASL第4版平台进行了基因表达谱分析,此外还包括来自第3版平台的71份重复样本和来自GSE32918的12份重复样本。随后,根据文章中提出的分子分类器,将患者分类为BL和DLBCL。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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