将基因组学转化至临床:区分Burkitt与弥漫大B细胞淋巴瘤(v4)

该数据集来自NCBI GEO,包含156例新患者FFPE活检组织的RNA基因表达谱数据,使用Illumina DASL v4平台检测,另含71例v3平台重复样本和12例来自GSE32918的重复样本

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL149519606
GSE69051: Transferring genomics to the clinic: distinguishing Burkitt and Diffuse large B-cell lymphoma (v4)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

将基因组学转化至临床:区分Burkitt与弥漫大B细胞淋巴瘤(v4)

Transferring genomics to the clinic: distinguishing Burkitt and Diffuse large B-cell lymphoma (v4)

该数据集来自NCBI GEO,包含156例新患者FFPE活检组织的RNA基因表达谱数据,使用Illumina DASL v4平台检测,另含71例v3平台重复样本和12例来自GSE32918的重复样本。数据用于通过文章提出的分子分类器将患者分为Burkitt淋巴瘤(BL)和弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL),可支撑淋巴瘤分子分型相关的分类建模与验证研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 19 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):对156例新患者福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)活检组织提取的RNA使用Illumina DASL第4版平台进行基因表达谱检测,另含71例来自第3版平台的重复样本和12例来自GSE32918的重复样本。随后根据文章提出的分子分类器将患者分为BL和DLBCL。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL14951、9606。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE69051

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 24 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对156例新患者的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)活检组织提取的RNA,使用Illumina DASL第4版平台进行了基因表达谱分析,此外还包括来自第3版平台的71份重复样本和来自GSE32918的12份重复样本。随后,根据文章中提出的分子分类器,将患者分类为BL和DLBCL。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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