GSE66714:滤泡性淋巴瘤向DLBCL转化主调控因子的siRNA smart pool沉默
研究聚焦滤泡性淋巴瘤向弥漫性大B细胞淋巴瘤转化的主调控因子,采用siRNA smart pool沉默策略并结合MARINa算法推断候选调控因子

基本信息
资源简介
GSE66714:滤泡性淋巴瘤向DLBCL转化主调控因子的siRNA smart pool沉默
siRNA smart pool silencing of master regulators of Follicular Lymphoma transformation to DLBCL
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE66714_series_matrix.txt.gz),基于GPL10558表达谱芯片平台,物种为9606(人)。研究聚焦滤泡性淋巴瘤向弥漫性大B细胞淋巴瘤转化的主调控因子,采用siRNA smart pool沉默策略并结合MARINa算法推断候选调控因子。数据可用于淋巴瘤转化机制探索及基因表达模式分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 09 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):滤泡性淋巴瘤(FL)是非霍奇金淋巴瘤最常见的惰性亚型,总体生存率相对较长,从诊断时起为6至10年。然而,20-60%的FL患者会转化为侵袭性弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL),中位生存期缩短至约1.2年。FL转化的具体功能和遗传决定因素仍不明确,仅有相对较小比例的病例可由TP53、MYC和BCL6的已确立、复发性改变,CDKN2A和CDKN2B的失活,或REL的扩增来解释。我们通过使用主调控因子推断算法(MARINa)对具有FL转化特征的B细胞特异性调控模型进行系统分析,来弥补这一缺陷。我们显示,该算法在FL中推断的候选主调控因子诱导合成
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66714
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
滤泡性淋巴瘤(FL)是非霍奇金淋巴瘤中最常见的惰性亚型,总体生存率相对较长,从诊断时起为6至10年。然而,20-60%的FL患者会转化为侵袭性弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL),中位生存期缩短至约1.2年。FL转化的具体功能和遗传决定因素仍不明确,仅有相对较小比例的病例可由TP53、MYC和BCL6中已确立的反复改变、CDKN2A和CDKN2B的失活或REL的扩增来解释。我们通过使用主调控因子推断算法(MARINa)对具有FL转化特征的B细胞特异性调控模型进行系统分析,来弥补这一不足。我们表明,该算法在FL中推断出的候选主调控因子可在DLBCL细胞中诱导合成致死,并导致鉴定出特定的化合物组合,这些组合在转化的DLBCL细胞中诱导协同性的活力丧失。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




