GSE66415:抗蛋白酶体治疗通过MYC和CHK1依赖性细胞死亡作用于T细胞淋巴瘤和霍奇金淋巴瘤细胞系及人异种移植模型(Illumina)
该数据集来自NCBI GEO,包含一项针对T细胞淋巴瘤和霍奇金淋巴瘤细胞系及人异种移植模型的研究,使用Illumina表达谱芯片检测第二代蛋白酶体抑制剂ixazomib处理后的转录组变化

基本信息
资源简介
GSE66415:抗蛋白酶体治疗通过MYC和CHK1依赖性细胞死亡作用于T细胞淋巴瘤和霍奇金淋巴瘤细胞系及人异种移植模型(Illumina)
MYC and CHK1 Dependent Cell Death in T-cell Lymphoma and Hodgkin Lymphoma Cell Lines and Human Xenograft Models Via Anti-Proteasomal Therapy (Illumina)
该数据集来自NCBI GEO,包含一项针对T细胞淋巴瘤和霍奇金淋巴瘤细胞系及人异种移植模型的研究,使用Illumina表达谱芯片检测第二代蛋白酶体抑制剂ixazomib处理后的转录组变化。数据覆盖Jurkat、L540和L428等细胞系,可用于分析药物应答相关的基因表达调控、细胞周期、染色质修饰和DNA修复等生物学过程,并支持比较敏感与相对耐药细胞系的转录组差异(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 02 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们研究了强效第二代蛋白酶体抑制剂ixazomib在T细胞淋巴瘤和霍奇金淋巴瘤细胞系及人异种移植模型中的生物学效应。Ixazomib在所有细胞系中导致时间和剂量依赖性的细胞毒性和凋亡(IC50 <75nM)。通过SCID肿瘤异种移植进行的体内研究显示,与对照组相比,ixazomib治疗的小鼠在Jurkat和L540模型中肿瘤生长显著抑制(P<0.001),生存期显著改善(P<0.001)。通过全局转录组和网络分析,ixazomib处理的Jurkat和L540细胞在细胞周期调控、染色质修饰和DNA修复过程的生物学功能上显示出显著重叠,而在相对ixazomib耐药的细胞系L428中未观察到保守性。此外,肿瘤抑制因子和癌基因的预测激活和抑制状态
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10558、9606。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66415
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 13 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
我们研究了强效第二代蛋白酶体抑制剂ixazomib在T细胞淋巴瘤和霍奇金淋巴瘤细胞系及人源异种移植模型中的生物学效应。Ixazomib在所有细胞系中均导致时间和剂量依赖性的细胞毒性和凋亡(IC50值<75nM)。通过SCID肿瘤异种移植进行的体内研究显示,与对照组相比,ixazomib治疗的小鼠在Jurkat和L540模型中肿瘤生长显著受到抑制(P<0.001),生存期显著改善(P<0.001)。通过全局转录组和网络分析,ixazomib处理的Jurkat和L540细胞在细胞周期调控、染色质修饰和DNA修复过程的生物学功能上显示出显著重叠,而在相对耐药的细胞系L428中未观察到这种保守性。此外,肿瘤抑制因子和癌基因的预测激活与抑制状态强烈支持ixazomib对肿瘤进展的抑制作用。最值得注意的是,ixazomib下调了MYC及其靶基因的蛋白水平。另外,染色质免疫沉淀显示组蛋白H3乙酰化影响MYC水平及细胞对ixazomib的死亡反应。
此外,使用JQ1抑制MYC在L428细胞中导致了协同性细胞死亡,这一结果通过MYC基因敲除得到了证实。总体而言,ixazomib在TCL和HL中下调了MYC及其下游底物,而耐药性的出现似乎是通过MYC和CHK1依赖机制介导的。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




