GSE66299：miR-18b过表达识别预后不良的套细胞淋巴瘤患者并改进MIPI-B预后评估

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66299

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数据说明

近期研究显示，套细胞淋巴瘤（MCL）表达异常的miRNA谱，然而，miRNA表达的临床效应此前尚未在前瞻性、大规模、统一治疗的队列中进行考察和验证。我们分析了来自北欧MCL2和MCL3临床试验的诊断性MCL样本，其中所有患者均接受了利妥昔单抗-大剂量阿糖胞苷与利妥昔单抗-maxiCHOP交替方案，随后进行BEAM方案和自体干细胞支持。我们对来自MCL2试验（筛选队列）的74份诊断性MCL样本进行了全基因组miRNA微阵列分析。差异表达的miRNA通过qRT-PCR重新分析。预后相关miRNA在来自独立MCL3试验（验证队列）94例患者的诊断性MCL样本中通过qRT-PCR进行验证。在筛选队列和验证队列中，三种miRNA（miR-18b、miR-92a、miR-378d）在死于MCL的患者中均显著差异表达。MiR-18b在预测高风险方面优于miR-92a和miR-378d。因此，我们生成了一种新的MIPI-B-miR预后评估工具，将miR-18b的表达水平与MIPI-B数据相结合。

与MIPI-B相比，该预后指标在病因特异性生存（P=0.015）、总生存（P=0.006）和无进展生存（P<0.001）方面均提高了高危患者的识别能力。用miR-18b转染两种MCL细胞系可降低其增殖速率而不诱导凋亡，提示miR-18b可能通过减缓细胞增殖使MCL细胞对化疗产生耐药。因此，我们得出结论：miR-18b过表达可在两个大型前瞻性MCL队列中识别预后不良的患者，并为MIPI-B增加预后信息。MiR-18b可能通过降低MCL细胞的增殖速率作为化疗耐药的机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。