EBV潜伏膜蛋白1对microRNA簇miR-183-96-182表达的调控

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE65752

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数据说明

EB病毒（EBV）是一种致癌性人类疱疹病毒，参与伯基特淋巴瘤（BL）及其他多种淋巴增殖性疾病的发病机制。在BL中，EBV蛋白表达仅限于EBNA-1，但也可检测到小非编码RNA，如EBERs和微小（mi）RNA。miRNA在增殖、分化和细胞死亡等关键过程中发挥重要作用。近期研究已明确，miRNA表达谱的改变参与多种恶性肿瘤的发病机制。在潜伏感染期间，EBV表达25种病毒前体miRNA，并调节特定细胞miRNA（如miR-155和miR-146）的表达，这些miRNA可能在肿瘤发生中发挥作用。本研究建立了三种BL细胞系的小RNA表达谱。通过大规模测序结合Northern印迹和实时RT-PCR分析验证，我们证明了某些细胞和病毒miRNA的差异表达。miR-183-96-182簇和EBV miR-BART簇的高水平表达与EBV I型潜伏感染显著相关。

该表达未受病毒再激活的影响，因为TGF-β1刺激并未显著改变miRNA谱。然而，潜伏膜蛋白(LMP)-1的表达触发了miR-183-96-182簇表达的下调。我们进一步表明，这一效应涉及AKT信号通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。