IRF4作为主转录因子调控BCR信号、抗原加工呈递及生发中心发育相关基因的表达谱芯片数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE64269

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

干扰素调节因子4（IRF4）是生发中心B细胞成熟所必需的主转录因子，这些B细胞最终发育为分泌抗体的浆细胞和记忆B细胞。IRF4缺陷小鼠血清免疫球蛋白水平显著降低。尽管关于IRF4与B细胞生物学的信息十分丰富，但对该转录因子在B细胞发育过程中作用的复杂分子细节仍知之甚少。因此，我们通过ChIP-chip分析在生发中心来源的BL2伯基特淋巴瘤细胞中检测了IRF4的全基因组靶点。ChIP研究进一步辅以shRNA介导的IRF4敲低后的全基因组表达分析。我们的研究揭示，IRF4调控对以下方面重要的基因表达：a）BCR信号传导；b）MHC介导的抗原加工与呈递。此外，我们发现IRF4可能以某种方式参与调控LTA、LTB和CXCR5，这些因子参与免疫系统发育，特别是与明区发育相关的基因，如调控FDC聚集的基因以及参与B细胞发育的IL21R和IL10。

另一方面，IRF4抑制氧化磷酸化途径中的基因。我们的发现揭示了IRF4在生发中心B细胞发育中此前未被探索的作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。