霍奇金淋巴瘤中NF-κB亚基p52的基因表达谱

该数据集为霍奇金淋巴瘤(HL)细胞中NF-κB非经典亚基p52的基因表达谱,来源于NCBI GEO(GSE64234),采用表达谱芯片(GPL6244)检测

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时间序列分类Expression profiling by arrayGPL62449606
GSE64234: Gene expression profile of the NF-κB subunit p52 in Hodgkin’s lymphoma

基本信息

模态
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分类
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

霍奇金淋巴瘤中NF-κB亚基p52的基因表达谱

Gene expression profile of the NF-κB subunit p52 in Hodgkin’s lymphoma

该数据集为霍奇金淋巴瘤(HL)细胞中NF-κB非经典亚基p52的基因表达谱,来源于NCBI GEO(GSE64234),采用表达谱芯片(GPL6244)检测。研究在HL细胞系L-1236中单独敲低p52,以分析其在基因 repression 中的作用,发现单独敲低p52足以上调一组可能与B细胞和/或HL发育相关的基因。数据可用于研究p52在HL基因调控中的功能及筛选相关靶基因(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 16 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):霍奇金淋巴瘤(HL)细胞的恶性细胞以经典和非经典NF-κB信号通路的组成性激活为特征。在HL细胞系L-1236中敲低对应于非经典NF-κB二聚体(p52/RelB)的亚基组合,导致一组与造血和淋巴器官发育相关的基因上调。由于p52可形成同源二聚体复合物,该复合物可单独或与HDAC1等转录抑制因子结合而抑制转录,因此我们单独敲低p52以分析其在HL细胞基因抑制中的作用。我们发现,单独敲低p52确实足以上调一组可能参与B细胞和/或HL发育的有趣基因。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL6244、9606。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE64234

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 26 201,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

霍奇金淋巴瘤(HL)的恶性细胞特征在于经典及非经典NF-κB信号通路的组成性激活。在HL细胞系L-1236中,敲低对应于非经典NF-κB二聚体(p52/RelB)的亚基组合,导致一组与造血和淋巴器官发育相关的基因上调。由于p52能形成同源二聚体复合物,这些复合物可单独或与转录抑制因子如HDAC1结合来抑制转录,我们单独敲低了p52,以分析其在HL细胞基因抑制中的作用。我们发现,单独敲低p52确实足以上调一组有趣的基因,这些基因可能在B细胞和/或HL发育中发挥作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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