GSE56235：U2932细胞中PRDM11敲低效应
数据可用于研究PRDM11敲低对U2932细胞转录组的影响，进而探索PRDM11作为肿瘤抑制因子在B细胞淋巴瘤发生中的调控机制（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
GSE56235：U2932细胞中PRDM11敲低效应
Effect of PRDM11 depletion in U2932 cells
该数据集来自NCBI GEO，标题为“Effect of PRDM11 depletion in U2932 cells”，属于肿瘤/淋巴瘤分类，包含1个文件（GSE56235_series_matrix.txt.gz），采用高通量测序进行表达谱分析，物种为人类（9606），平台为GPL11154。数据可用于研究PRDM11敲低对U2932细胞转录组的影响，进而探索PRDM11作为肿瘤抑制因子在B细胞淋巴瘤发生中的调控机制（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 26 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：PR结构域家族（PRDMs）编码转录调控因子，其中若干成员在癌症中失调。我们发现Prdm11缺失加速了Eµ-Myc小鼠模型中的MYC驱动淋巴瘤发生。此外，我们显示PRDM11缺陷的弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者总生存期较差，且属于非生发中心B细胞（GCB）样亚型。机制上，PRDM11结合位点的全基因组定位结合人DLBCL细胞中的转录组测序证明，PRDM11与靶基因的转录起始位点相关联，并调控FOS和JUN等重要癌基因。因此，我们将PRDM11鉴定为控制关键癌基因表达的新型肿瘤抑制因子，并为B细胞淋巴瘤发生增添了新的机制见解。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL11154、9606。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE56235
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE56235
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
PR结构域家族e（PRDMs）编码转录调节因子，其中若干成员在癌症中失调。我们发现，在Eµ-Myc小鼠模型中，Prdm11缺失加速了MYC驱动的淋巴瘤发生。此外，我们显示PRDM11缺陷型弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者的总生存期较差，且属于非生发中心B细胞（GCB）样亚型。在机制上，通过全基因组定位PRDM11结合位点并结合人DLBCL细胞的转录组测序，证实PRDM11与靶基因的转录起始位点相关联，并调控FOS和JUN等重要癌基因。因此，我们将PRDM11鉴定为控制关键癌基因表达的新型肿瘤抑制因子，并为B细胞淋巴瘤发生提供了新的机制见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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