Tristetraprolin 是抑癌因子:损害 Myc 诱导的淋巴瘤并消除恶性状态 [逆转录病毒感染的离体淋巴瘤]
该数据集来自 NCBI GEO(GSE37791),包含 1 个文件 GSE37791_series_matrix.txt.gz,采用表达谱芯片(GPL1261,小鼠 10090)对逆转录病毒感染的离体淋巴瘤样本进行转录组分析
![GSE37791: Tristetraprolin is a tumor suppressor that impairs Myc-induced lymphoma and abolishes the malignant state [retrovirally infected ex vivo lymphoma]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/164311.jpg)
基本信息
资源简介
Tristetraprolin 是抑癌因子:损害 Myc 诱导的淋巴瘤并消除恶性状态 [逆转录病毒感染的离体淋巴瘤]
Tristetraprolin is a tumor suppressor that impairs Myc-induced lymphoma and abolishes the malignant state [retrovirally infected ex vivo lymphoma]
该数据集来自 NCBI GEO(GSE37791),包含 1 个文件 GSE37791_series_matrix.txt.gz,采用表达谱芯片(GPL1261,小鼠 10090)对逆转录病毒感染的离体淋巴瘤样本进行转录组分析。研究聚焦 Myc 癌蛋白与 mRNA 稳定性调控,涉及含 AU 富集元件基因及 Tristetraprolin(TTP/ZFP36)等 AU 结合蛋白,可用于探索 Myc 诱导淋巴瘤中基因表达变化及 TTP 作为抑癌因子的作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 05 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Myc 癌蛋白通过结合靶基因直接调控转录,但这只能解释受 Myc 影响基因的一部分。mRNA 周转由 AU 结合蛋白(AUBPs)控制,这些蛋白识别许多转录本中存在的 AU 富集元件(AREs)。对癌前和恶性 Myc 表达 B 细胞的分析显示,Myc 调控数百个含 ARE(ARED)的基因和部分 AUBPs。值得注意的是,Myc 直接抑制 Tristetraprolin(TTP/ZFP36)的转录,这是一种 mRNA 去稳定化 AUBP,且该回路在 B 淋巴细胞生成和 IL7 信号传导过程中也发挥作用。重要的是,TTP 抑制是涉及 MYC 的癌症的一个标志,恢复 TTP 可损害 Myc 诱导的淋巴瘤发生并消除恶性状态的维持。此外,恶性病变中存在对 TTP 缺失的选择;因此,TTP 作为抑癌因子发挥作用。最后,Myc/T
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL1261、10090。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE37791
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 11 201,引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
Myc癌蛋白通过结合靶基因直接调控转录,但这仅能解释受Myc影响基因的一部分。mRNA周转受AU结合蛋白(AUBPs)控制,这些蛋白识别许多转录本中存在的AU富集元件(AREs)。对表达Myc的癌前和恶性B细胞的分析显示,Myc调控数百个含ARE(ARED)的基因以及特定的AUBPs。值得注意的是,Myc直接抑制Tristetraprolin(TTP/ZFP36)的转录,这是一种mRNA去稳定化的AUBP,且该回路在B淋巴细胞生成和IL7信号传导过程中也同样运作。重要的是,TTP抑制是涉及MYC的癌症的一个标志,恢复TTP可损害Myc诱导的淋巴瘤发生并消除恶性状态的维持。此外,恶性肿瘤中存在TTP缺失的选择;因此,TTP起到肿瘤 suppressor 的作用。最后,由Myc/TTP指导的特定癌症相关ARED基因的控制在淋巴瘤发生过程中被禁用。因此,Myc靶向AUBPs以调控控制肿瘤发生的ARED基因。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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