弥漫性大B细胞淋巴瘤中LMO2转录组与相互作用组鉴定

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE34576

标准获取流程：

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数据说明

LMO2调控基因表达，促进多部分DNA结合复合物的形成。在B细胞中，LMO2在生发中心（GC）反应中特异性上调，并在GC衍生的非霍奇金淋巴瘤中表达。LMO2是DLBCL患者中最有力的预后指标之一。然而，其在GC B细胞和DLBCL中的功能目前尚不清楚。在本研究中，我们表征了DLBCL细胞中LMO2的转录组和相互作用组。LMO2调控与动粒功能、染色体组装和有丝分裂相关的基因。在DLBCL细胞系中过表达LMO2会导致中心体扩增。在DLBCL中，LMO2复合物包含一些传统伙伴，如LDB1、E2A、HEB、Lyl1、ETO2和SP1，但不包含TAL1或GATA蛋白。此外，我们鉴定了新的LMO2相互作用伙伴：ELK1、NFATc1和LEF-1蛋白。报告基因实验显示，LMO2增加NFATc1的转录活性，降低LEF-1蛋白的转录活性。总体而言，我们的研究在DLBCL中鉴定了一个新的LMO2转录组和相互作用组，为未来阐明LMO2在GC B细胞和DLBCL发病机制中的功能提供了平台。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。