SLC15A3介导二肽代谢经mTORC1激活赋予淋巴瘤抗代谢药耐药性[Ribo-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE328313

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

抗代谢药物是靶向核苷酸生物合成的化疗药物，属于最早且应用最广泛的癌症治疗手段之一，然而耐药性仍是严峻的障碍，尤其是在对抗B细胞淋巴瘤的过程中。然而，这种耐药性的潜在机制长期以来一直难以阐明。我们采用创新的整合组学方法，意外发现二肽的积累和二肽转运蛋白SLC15A3的上调是Myc驱动的大B细胞淋巴瘤小鼠模型中对核苷酸缺乏产生耐药性的基础。在人B细胞淋巴瘤细胞长期接受化疗药物嘌呤合成抑制剂6-巯基嘌呤（6MP）处理后，也出现了类似的机制。在机制层面，我们证明含有必需氨基酸的二肽激活了促进生长和存活的mTORC1信号通路。值得注意的是，SLC15A3特异性地与溶酶体上的mTOR相互作用，选择性地增强耐药淋巴瘤细胞中的mTORC1活性，而在亲本癌细胞中则不然。沉默SLC15A3可降低mTORC1活性并恢复耐药淋巴瘤对6MP的敏感性。

引人注目的是，耐药性淋巴瘤而非原发性肿瘤在体外培养和体内均对临床mTOR抑制剂雷帕霉素表现出高度敏感性。我们在人类淋巴瘤活检样本中进一步验证了这些发现，显示抗代谢药物治疗后SLC15A3表达增加。总之，我们的研究揭示了一种此前未被认识的代谢适应机制，该机制促进了癌症对核苷酸缺乏的耐药性，并将mTORC1抑制剂雷帕霉素定位为一种潜在的治疗策略，有望改变化疗耐药性淋巴瘤的管理方式。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。