单细胞测序揭示滤泡性淋巴瘤患者副肿瘤性天疱疮的动态免疫特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318717

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数据说明

背景：副肿瘤性天疱疮（PNP）是一种高度致命的自身免疫性大疱性疾病，常发生于伴有潜在良性或恶性肿瘤的患者。该病在诊断和治疗方面面临重大挑战。迄今为止，PNP发病机制的细胞和分子机制在很大程度上仍不清楚。目的：本研究旨在通过分析整个治疗过程中的动态免疫格局，阐明PNP的细胞和分子机制，尤其是继发于淋巴瘤时的情况。方法：我们对一名伴有PNP的滤泡性淋巴瘤（FL）患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和骨髓细胞（BMCs）进行了单细胞转录组测序和单细胞T细胞受体（TCR）分析。样本采集于三个关键时间点：治疗前、治疗期间和治疗成功后。结果：治疗前，我们观察到PBMCs中ITGAL+ T细胞、异常γδT细胞亚型和BCL2+ B细胞的特异性富集。值得注意的是，BMCs中也富集了初始T细胞和一种异常的B细胞亚型。

单细胞转录组结果绘制了淋巴瘤相关肿瘤微环境图谱，并揭示了治疗后的免疫重建。这种重建涉及激活的DNA损伤反应和T细胞免疫应答，随着治疗进展TCR克隆逐渐扩增的观察进一步支持了这一点。结论：我们的研究描绘了一名FL相关PNP患者在整个治疗过程中的动态免疫景观，证明成功的治疗与涉及特定T细胞应答和TCR克隆扩增的免疫重建相关。这些发现为PNP的细胞和分子机制提供了新的见解，尤其是在继发于淋巴瘤的病例中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。