GSE313235：连接赖氨酸乙酰转移酶与癌基因导向细胞死亡的双价分子胶 [CUT&RUN]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313235

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

赖氨酸乙酰转移酶（KATs），如p300和CBP，通过支架转录机器以及乙酰化染色质和转录因子（TFs），在健康和恶性细胞中调控基因网络。在包括弥漫性大B细胞淋巴瘤在内的某些癌症中，它们有助于肿瘤抑制，并在失调时成为治疗脆弱点。KATs的抑制剂和降解剂因靶向这些必需蛋白可能带来的毒性而受到限制。我们引入了KAT-TCIPs（赖氨酸乙酰转移酶转录/表观遗传化学邻近诱导剂），这是一种双价分子，能将p300和CBP的KAT及共激活活性重定向至受致癌转录因子BCL6抑制的程序性细胞死亡信号。先导KAT-TCIP分子通过重新分布染色质乙酰化、激活促凋亡蛋白PUMA并抑制c-MYC，以约0.8 nM的浓度杀死淋巴瘤细胞。对包含p300和BCL6的三元共晶结构的分析揭示了驱动KAT-TCIPs效力和特异性的偶然相互作用，并为靶向KAT的邻近诱导疗法开创了先例。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。