患者来源淋巴瘤球体揭示复发难治性B-NHL中Glofitamab耐药预测标志物

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306092

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数据说明

双特异性抗体（bsAbs）如glofitamab是治疗复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤（R/R B-NHL）的一种有前景的治疗方法，但其耐药机制仍知之甚少。本研究旨在基于从R/R B-NHL样本建立的3D患者来源淋巴瘤球体（PDLS）的反应，识别bsAbs耐药的预测标志物。PDLS用0.1 nM glofitamab处理3天，并量化B细胞耗竭作为离体治疗反应的指标。使用多参数流式细胞术、单细胞RNA测序、CODEX空间蛋白质组学和功能测定对患者样本进行了全面的免疫分析。本研究揭示，对glofitamab高反应者拥有更多具有更高细胞毒性特征的活化CD8+ T细胞，而低反应者则显示富集的耗竭CD8+ T细胞群体，耗竭标志物（TIGIT、LAG3、PD1）表达增强。此外，低反应者表现出功能性的CD4+ T滤泡辅助（Tfh）细胞升高，这些细胞紧邻恶性B细胞，从而通过IL21和CXCL13信号通路促进其存活。

功能实验表明，加入抗TIGIT联合治疗可增强glofitamab在低应答样本中的疗效，而Tfh细胞耗竭则改善了细胞毒性T细胞功能。我们的研究结果确定了CD8+ T细胞耗竭和功能活化的Tfh细胞是R/R B-NHL中对glofitamab的关键耐药机制。靶向这些通路是克服双特异性抗体耐药并改善治疗结局的一种有前景的策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。