AITL小鼠模型中肿瘤性Tfh样细胞亚群的鉴定
该数据集来自NCBI GEO,标题为AITL小鼠模型中肿瘤性Tfh样细胞亚群的鉴定,包含1个文件(GSE303738_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247

基本信息
资源简介
AITL小鼠模型中肿瘤性Tfh样细胞亚群的鉴定
Identification of a neoplastic Tfh-like cellular subset in a mouse model of angioimmunoblastic T cell lymphoma (AITL)
该数据集来自NCBI GEO,标题为AITL小鼠模型中肿瘤性Tfh样细胞亚群的鉴定,包含1个文件(GSE303738_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。数据可用于研究AITL中Tfh样细胞亚群的转录特征,探索肿瘤进展相关细胞亚群及潜在可成药靶点(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 25 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):结节性T滤泡辅助细胞淋巴瘤,血管免疫母细胞型(nTFHL-AI,或AITL),是一种缺乏有效治疗方法的侵袭性外周T细胞淋巴瘤。已有研究表明,遗传和表观遗传改变导致起源于T滤泡辅助(Tfh)细胞的肿瘤性CD4+ T细胞扩增,随后引起B细胞扩增和肿瘤。然而,目前尚不清楚Tfh样细胞群体中是否包含驱动肿瘤进展的亚群,以及如果存在,这样的亚群是否具有可成药靶点。使用由杂合sanroque突变(Roquinsan/+)驱动的AITL小鼠模型,我们鉴定出一个肿瘤富集的Tfh细胞亚群,高表达CXCR6和IL-18受体,称为“双表达(DE)Tfh”细胞。DE Tfh细胞还表达更高水平的zeste同源物2增强子(EZH2)。体外数据表明,IL-18和EZH2是pr所必需的
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE303738
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 12 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
结节性T滤泡辅助细胞淋巴瘤,血管免疫母细胞型(nTFHL-AI,或AITL),是一种侵袭性外周T细胞淋巴瘤,目前缺乏有效治疗方法。已有研究表明,遗传和表观遗传改变导致起源于T滤泡辅助(Tfh)细胞的肿瘤性CD4+ T细胞扩增,继而引起B细胞扩增和肿瘤形成。然而,目前尚不清楚Tfh样细胞群体中是否包含驱动肿瘤进展的亚群,若存在,该亚群是否具有可成药靶点。利用由杂合sanroque突变(Roquinsan/+)驱动的AITL小鼠模型,我们鉴定出一个高度表达CXCR6和IL-18受体的肿瘤富集Tfh细胞亚群,将其命名为“双表达(DE)Tfh”细胞。DE Tfh细胞还表达更高水平的zeste同源物增强子2(EZH2)。体外数据表明,IL-18和EZH2是DE Tfh细胞增殖所必需的。此外,DE Tfh细胞在过继转移至淋巴细胞减少受体后具有强大的B细胞扩增能力。
另一方面,通过Ezh2基因缺失、抑制EZH2(使用FDA批准的药物他泽司他)或抗CXCR6单克隆抗体来清除DE Tfh细胞,可导致肿瘤消退。这些发现可能与一部分AITL病例相关,因为我们发现约20-30%的AITL患者样本同时具有CXCR6、IL-18R1和IFNG表达升高。因此,我们的研究在小鼠模型中鉴定出一个对AITL肿瘤进展至关重要的致病性Tfh样亚群,并提示在AITL患者中识别并靶向DE Tfh样亚群可能是一种有效的策略。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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