GSE301732：Ro 08-2750 通过失调 DNA 损伤应答增加 DLBCL 放疗诱导的细胞毒性

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301732

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数据说明

引言 当前的研究工作旨在提高弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的治疗疗效。在此，我们评估了小分子抑制剂Ro 08-2750对DLBCL治疗诱导的细胞毒性的影响。材料与方法 首先，我们通过细胞活力和集落形成实验验证细胞毒性，从而在DLBCL中建立Ro 08-2750处理。下一步，通过流式细胞术分析降低细胞活力的功能性效应，例如细胞周期失调和细胞凋亡。然后，我们在细胞活力和集落形成实验中评估了Ro 08-2750对细胞毒性治疗的影响。在通过γH2AX实验确认照射诱导的DNA损伤增加后，使用基于免疫印迹的实验检测DNA损伤应答的变化。最后，我们通过RT-qPCR、RNA测序、蛋白质印迹和蛋白质组学分析，分析了Ro 08-2750诱导的基因和蛋白质表达变化。结果 Ro 08-2750以剂量依赖性方式降低DLBCL中的细胞活力。在功能上，细胞活力的降低伴随细胞周期失调，具体表现为S期增加且G2/M期减少，以及细胞凋亡增加。

DNA合成在S期减少。在评估治疗相关性时，Ro 08-2750使DLBCL细胞系对放射敏感，但对化疗不敏感，并增加了放射诱导的双链断裂。我们发现CHK2磷酸化存在失调。此外，基因组和蛋白质组学分析显示，Ro 08-2750扰乱了DNA损伤反应。结论：我们将Ro 08-2750确定为DLBCL中潜在的放射增敏剂。因此，我们的结果表明靶向RNA结合蛋白具有潜在的治疗益处。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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