D419N突变对EuMyc小鼠淋巴瘤细胞STAT6转录因子活性的影响
该数据集来自NCBI GEO，研究STAT6第419位天冬氨酸突变为天冬酰胺（D419N）对EuMyc小鼠淋巴瘤肿瘤细胞基因表达的影响
基本信息
资源简介
D419N突变对EuMyc小鼠淋巴瘤细胞STAT6转录因子活性的影响
GSE299157 数据集来自 NCBI GEO，聚焦于 STAT6 转录因子第 419 位氨基酸由天冬氨酸突变为天冬酰胺（D419N）后，对 EuMyc 小鼠淋巴瘤肿瘤细胞基因表达所产生的影响。该数据集属于肿瘤/淋巴瘤分类，采用高通量测序进行表达谱分析，旨在从转录层面刻画这一突变如何改变淋巴瘤细胞的基因表达格局。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE299157_series_matrix.txt.gz，由 Madelyn J. Abraham 提交，发布时间为 Jun 06 202（源站记录如此）。整体而言，该数据集为研究 STAT6 突变在淋巴瘤中的功能后果提供了直接的表达谱资源。
【数据集背景】
STAT6 是重要的转录因子，参与细胞因子信号传导与基因表达调控。在淋巴瘤等肿瘤中，STAT6 的突变可能影响其转录活性，进而改变下游基因表达程序。该数据集的研究目的正是考察 STAT6 第 419 位残基（D419）发生 D419N 突变后，对 EuMyc 小鼠淋巴瘤肿瘤细胞基因表达的影响。EuMyc 小鼠淋巴瘤模型是研究淋巴瘤发生与进展的常用体系，将 STAT6 突变引入该背景，有助于理解该突变在肿瘤细胞转录调控中的作用。源站描述明确指出，研究旨在探究 STAT6 在 D419 位点的突变如何影响 EuMyc 淋巴瘤肿瘤细胞中的基因表达。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”，表明其数据类型为基于高通量测序的表达谱数据。平台信息标注为 GPL13112，物种信息标注为 10090（即小鼠）。数据集共包含 1 个文件，文件样例为 GSE299157_series_matrix.txt.gz，属于系列矩阵文件，通常用于汇总样本的表达测量值及样本注释信息。数据内容围绕 STAT6 D419N 突变对 EuMyc 淋巴瘤细胞基因表达的影响展开，可用于比较突变与对照条件下的表达差异。关于具体的样本数量、分组设计、测序深度、基因数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“Effect of D419N mutation on STAT6 transcription factor activity, in EuMyc murine lymphoma cells”。作者为 Madelyn J. Abraham，发布时间记录为 Jun 06 202。数据以高通量测序方式进行表达谱采集，平台编号为 GPL13112，物种为小鼠（10090）。关于样本采集的具体组织来源、处理流程、测序平台型号、建库方法等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 STAT6 D419N 突变对淋巴瘤细胞转录组影响的场景，例如分析突变引起的差异表达基因、探讨 STAT6 转录活性改变的下游效应，以及结合 EuMyc 小鼠淋巴瘤模型开展肿瘤信号通路研究。由于数据类型为高通量测序表达谱，也可用于与其他淋巴瘤表达谱数据的比较分析或作为方法学验证的参考数据。关于该数据集是否适用于临床样本分析、药物响应预测等特定用途，源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时，可下载数据文件 GSE299157_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。系列矩阵文件通常包含表达值矩阵与样本注释信息，可在读取后根据样本分组进行差异表达分析等下游处理。关于具体的分析流程、标准化方法或推荐软件，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，数据规模有限；关于样本重复数、测序质量、数据完整性等信息，源站未提供。使用时应注意该数据基于小鼠 EuMyc 淋巴瘤细胞模型，其结果向其他物种或肿瘤类型的推广需谨慎。发布时间记录为“Jun 06 202”，年份信息不完整，源站未提供更明确的日期说明。此外，关于数据是否存在批次效应、是否经过标准化处理等质量控制细节，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Madelyn J. Abraham，来源为 NCBI GEO。关于具体的引用文献、许可条款或使用限制，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据时，应遵循 NCBI GEO 的相关政策与源站要求。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299157
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
To investigate how mutation of STAT6 at residue D419 impacts gene expression in EuMyc lymphoma tumour cells
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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