原发性睾丸弥漫大B细胞淋巴瘤预后microRNA表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298277

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

原发睾丸（PT）弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）是一种罕见且侵袭性强的淋巴瘤，具有独特的临床和分子特征。为进一步改善PT-DLBCL的预后，不仅需要更好地了解PT-DLBCL的常见特征，还需要深入了解PT-DLBCL实体内的分子异质性。本研究采用下一代测序技术，对150例PT-DLBCL患者RNA样本中的2083个microRNA和13个管家基因进行了测序。经过质量控制、CPM标准化和归一化后，获得了113例PT-DLBCL患者的microRNA表达谱数据。我们的分析鉴定出一个microRNA特征（包含35个microRNA），可将113例PT-DLBCL患者聚类为两个不同的簇。16个microRNA（miR-514a-3p、miR-202-3p、miR-509-5p、miR-509-3-5p、miR-506-3p、miR-508-3p、miR-514b-5p、miR-513a-5p、miR-510-5p、miR-513b-5p、miR-513c-5p、miR-508-5p、miR-509-3p、miR-202-5p、miR-507和miR-514b-3p）高表达的患者生存期显著更优。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。