BCL7A N端精氨酸锚定调控染色质重塑与DLBCL肿瘤抑制的RNA-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296461

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

hSWI/SNF（BRG1/BRM相关因子）染色质重塑复合物在调控染色质可及性和基因表达中发挥关键作用，其功能障碍与癌症相关。然而，其亚基BCL7A抑制肿瘤生长的具体机制，尤其是在弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中，仍不清楚。我们假设BCL7A的N端α-螺旋含有一个保守的精氨酸锚定残基，介导其与核小体酸性斑块的相互作用，从而调控染色质重塑和肿瘤抑制。我们的研究结果表明，该精氨酸锚定残基对于BCL7A与hSWI/SNF复合物的结合及其染色质重塑活性至关重要。破坏该锚定残基——无论是通过截短还是通过复发性DLBCL相关突变——均会废除BCL7A的肿瘤抑制功能，而不影响其掺入hSWI/SNF复合物。精氨酸锚定残基的缺失会全局性降低BCL7A在靶位点的占据，损害染色质可及性和转录调控。体内和细胞实验进一步证实，该精氨酸锚定残基对于BCL7A介导的肿瘤生长抑制至关重要。

本研究确定了BCL7A精氨酸锚定区作为一个关键分子开关，将核小体结合与染色质重塑及肿瘤抑制联系起来，为DLBCL的靶向治疗策略提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。