小鼠生发中心B细胞Crebbp R1446H敲入与敲除转录组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE292384

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CREBBP基因的截短突变和错义突变在滤泡性淋巴瘤(FL)和弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)这两种最常见的淋巴系统恶性肿瘤中高度流行。这些突变在肿瘤演化早期获得，导致乙酰转移酶(KAT)结构域中蛋白质完全缺失或单个氨基酸替换。因此，CREBBP乙酰化增强子组蛋白以及与生发中心(GC)反应相关的非组蛋白的能力受损，而GC正是这些肿瘤起源的结构。然而，KAT结构域的截短突变和错义突变在功能上是否等效仍未得到探索。利用针对高频Crebbp-R1446H氨基酸改变(CrebbpRH)的条件性GC特异性敲入小鼠模型，我们在此表明，与Crebbp完全缺失相比，错义突变体对GC反应施加了不同的定量和定性影响。CrebbpRH突变控制独特的转录程序，导致GC的癌前扩增，伴有结构异常、Tfh细胞百分比增加以及免疫反应偏向记忆B细胞分化。

CrebbpRH的表达本身足以在体内启动恶性转化，而Crebbp缺失则不具备这一能力，这表明前者具有更强的促肿瘤活性。我们的发现，连同错义突变和无义突变在FL和DLBCL中的差异性分布，对于淋巴瘤发生机制及其治疗靶向具有重要意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。