Karpas422异种移植瘤经vehicle或PRC2抑制剂C36处理的RNA-seq研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281570

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Polycomb抑制复合物2（PRC2）是一种保守的甲基转移酶，在组蛋白H3第27位赖氨酸上催化单、双和三甲基化（H3K27me1/me2/me3），从而抑制基因转录。EZH2是组蛋白甲基转移酶Polycomb抑制复合物2（PRC2）的催化亚基，EZH2体细胞功能获得性（GoF）突变是淋巴瘤的驱动因素。因此，EZH2/PRC2是癌症药物开发的关键靶点。在本研究中，我们从生化和结构角度表征了PRC2小分子抑制剂C36，并证明了其新颖的变构抑制机制。C36有效抑制H3K27三甲基化，并特异性阻止人肿瘤细胞系和异种移植肿瘤模型中PRC2靶基因的表达。通过转录组学和蛋白质组学研究，阐明了B细胞淋巴瘤中受PRC2抑制调控的关键通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。