核外泌体靶向复合物通过解析R环保障造血干细胞自我更新与基因组完整性

研究聚焦核外泌体靶向(NEXT)复合物核心亚基ZCCHC8在造血干细胞中的作用,涉及R环积累、DNA损伤与修复通路以及弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的失调

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE281554: Nuclear exosome targeting complex safeguards hematopoietic stem cell self-renewal and genomic integrity through resolving R loops

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

核外泌体靶向复合物通过解析R环保障造血干细胞自我更新与基因组完整性

Nuclear exosome targeting complex safeguards hematopoietic stem cell self-renewal and genomic integrity through resolving R loops

该数据集来自NCBI GEO(GSE281554),包含1个文件(GSE281554_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。研究聚焦核外泌体靶向(NEXT)复合物核心亚基ZCCHC8在造血干细胞中的作用,涉及R环积累、DNA损伤与修复通路以及弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的失调。数据可用于探索NEXT复合物维持造血干细胞自我更新和基因组完整性的表达层面机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 11 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):哺乳动物基因组的广泛转录产生大量非功能性新生转录本,形成R环及R环诱导的DNA断裂。然而,持续转录与R环形成爆发之间的这种耦合对造血干细胞(HSCs)维持基因组完整性构成挑战。在此,我们表明,核外泌体靶向(NEXT)复合物——一种将非功能性新生转录本靶向RNA外泌体进行降解的RNA衔接蛋白——在克服这一挑战中发挥关键作用。造血特异性敲除NEXT核心亚基ZCCHC8不仅导致HSC自我更新受损,还因R环积累而引起HSCs中DNA损伤升高和DNA修复通路上调。此外,ZCCHC8的失调在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中频繁发生,并与不良临

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281554

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 17 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281554

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哺乳动物基因组的广泛转录产生了大量非功能性新生转录本,从而形成R环及R环诱导的DNA断裂。然而,持续转录与R环形成爆发之间的这种耦合,给造血干细胞(HSCs)维持其基因组完整性带来了挑战。在此,我们证明,核外泌体靶向(NEXT)复合物——一种将非功能性新生转录本靶向RNA外泌体进行降解的RNA衔接因子——在克服这一挑战中发挥关键作用。造血特异性敲除ZCCHC8(NEXT的核心亚基)不仅导致HSC自我更新受损,还因R环积累而引起HSCs中DNA损伤增加和DNA修复通路上调。此外,ZCCHC8的失调在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中频繁发生,并与不良临床结局相关。总之,我们的发现凸显了NEXT作为HSCs新型保护因子的作用,并将其定位为DLBCL的潜在治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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