GSE275532：包括p53通路失调在内的转录组改变使DNMT3A突变细胞易于转化
研究涉及Dnmt3aR878H/+ LSK细胞在低剂量γ射线照射后的RNA测序，显示p53通路下调，并观察到PUMA表达降低
基本信息
资源简介
GSE275532：包括p53通路失调在内的转录组改变使DNMT3A突变细胞易于转化
Transcriptomic alterations including p53 pathway dysregulation prime DNMT3A mutant cells for transformation
该数据集来自NCBI GEO，包含1个文件（GSE275532_series_matrix.txt.gz），针对小鼠Dnmt3a R878H突变模型的高通量测序表达谱数据。研究涉及Dnmt3aR878H/+ LSK细胞在低剂量γ射线照射后的RNA测序，显示p53通路下调，并观察到PUMA表达降低。数据可用于分析DNMT3A突变细胞的转录组改变、p53信号失调及对应激刺激的易感性，为理解其向淋巴瘤转化的机制提供表达谱资源（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Aug 23 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：DNMT3A突变在血液系统恶性肿瘤中普遍存在。我们的小鼠模型将人类‘热点’R882H突变的小鼠同源物（R878H）引入小鼠Dnmt3a基因座，导致所有组织中DNA甲基化整体降低。携带杂合R878H突变的小鼠比对照小鼠更快发生γ辐射诱导的胸腺淋巴瘤，提示Dnmt3aR878H/+细胞对应激刺激存在脆弱性。在竞争性移植中，Dnmt3aR878H/+ Lin-Sca-1+Kit+（LSK）细胞比WT细胞具有竞争优势，表明其以分化为代价的自我更新表型。对暴露于低剂量γ辐射的Dnmt3aR878H/+ LSK细胞进行RNA测序显示p53通路下调。相应地，通过流式细胞术在γ辐射的Dnmt3aR878H/+小鼠骨髓中观察到由于p53信号改变导致的PUMA表达降低。这些发现p
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL19057、10090。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275532
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 19 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
DNMT3A突变在血液系统恶性肿瘤中普遍存在。我们的小鼠模型将人类“热点”R882H突变的小鼠同源突变（R878H）引入小鼠Dnmt3a基因座，导致所有组织中DNA甲基化全局性降低。携带杂合R878H突变的小鼠比对照小鼠更快地发生γ辐射诱导的胸腺淋巴瘤，提示Dnmt3aR878H/+细胞对应激刺激具有脆弱性。在竞争性移植中，Dnmt3aR878H/+ Lin-Sca-1+Kit+（LSK）细胞相较于野生型细胞具有竞争优势，表明其以分化为代价获得自我更新表型。对暴露于低剂量γ辐射的Dnmt3aR878H/+ LSK细胞进行RNA测序显示p53通路下调。相应地，通过流式细胞术在γ辐射后的Dnmt3aR878H/+小鼠骨髓中观察到PUMA表达降低，这是由于p53信号传导改变所致。这些发现为DNMT3A突变如何引起LSK细胞转录组的细微变化提供了新的见解，这些变化促成了其自我更新能力增强和恶性转化倾向。
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