GSE272006:IRF4促进滤泡性淋巴瘤免疫逃逸并塑造肿瘤微环境
源站描述显示,研究采用多组学方法,发现IRF4高表达的滤泡性淋巴瘤患者预后差、免疫信号失调且肿瘤微环境呈抑制性;功能获得与缺失实验及染色质 profiling 表明IRF4通过抑制抗原呈递和共受体基因模块削弱肿瘤细胞与T细胞互作,并促进拮抗TFH和Treg功能的细胞因子表达,同时重编程肿瘤代谢限制免

基本信息
资源简介
GSE272006:IRF4促进滤泡性淋巴瘤免疫逃逸并塑造肿瘤微环境
IRF4 promotes immune-evasion and shapes the Tumor Microenvironment in Follicular Lymphoma
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE272006_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/淋巴瘤。源站描述显示,研究采用多组学方法,发现IRF4高表达的滤泡性淋巴瘤患者预后差、免疫信号失调且肿瘤微环境呈抑制性;功能获得与缺失实验及染色质 profiling 表明IRF4通过抑制抗原呈递和共受体基因模块削弱肿瘤细胞与T细胞互作,并促进拮抗TFH和Treg功能的细胞因子表达,同时重编程肿瘤代谢限制免疫细胞葡萄糖可用性。沉默IRF4可抑制肿瘤生长并恢复免疫监视。数据可用于研究IRF4在滤泡性淋巴瘤免疫逃逸和微环境塑造中的作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 11 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):百分之二十的滤泡性淋巴瘤(FL)患者早期复发且预后不良;然而,这种侵袭性特征背后的分子机制尚不清楚。我们采用多组学方法表明,IRF4表达升高(IRF4hi)的FL患者预后差、免疫信号失调且肿瘤微环境呈抑制性。在IRF4hi淋巴瘤细胞中进行功能缺失和功能获得实验,并结合染色质 profiling,证明IRF4通过抑制抗原呈递和共受体基因模块来损害其与T细胞的相互作用,同时促进拮抗TFH和Treg功能的细胞因子表达。此外,IRF4重编程肿瘤代谢,从而限制免疫细胞的葡萄糖可用性。沉默IRF4可抑制肿瘤细胞生长并恢复免疫监视机制,因此代表一个有前景的治疗靶点。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272006
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 15 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272006
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
百分之二十的滤泡性淋巴瘤(FL)患者早期复发且预后不良;然而,导致这一侵袭性特征的分子机制尚不清楚。我们采用多组学方法发现,IRF4表达升高的(IRF4hi)FL患者预后较差,存在免疫信号失调及免疫抑制性肿瘤微环境。在IRF4hi淋巴瘤细胞中进行的基因功能缺失与功能获得实验,结合染色质图谱分析表明,IRF4通过抑制抗原呈递及共受体基因模块来损害其与T细胞的相互作用,同时促进拮抗TFH和Treg功能的细胞因子表达。此外,IRF4重塑肿瘤代谢,限制免疫细胞对葡萄糖的利用。沉默IRF4可抑制肿瘤细胞生长并恢复免疫监视机制,因而是一个有前景的治疗靶点。我们的数据提示,IRF4hi淋巴瘤细胞利用一种用于退出生发中心反应的发育机制,通过调动多种免疫逃逸机制促进更具侵袭性的癌症。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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