适应性免疫应答中B细胞经T细胞依赖性可塑状态转变
该数据集来自NCBI GEO,标题为适应性免疫应答中B细胞经T细胞依赖性可塑状态转变,归入肿瘤/淋巴瘤分类。研究关注生发中心B细胞在获得T细胞帮助后短暂获得功能可塑性(称为anaplasis)的过程,涉及B细胞程序部分沉默及胚胎干细胞超级增强子与基因再激活

基本信息
资源简介
适应性免疫应答中B细胞经T细胞依赖性可塑状态转变
B cells transition through a T cell dependent plastic state during the adaptive immune response
该数据集来自NCBI GEO,标题为适应性免疫应答中B细胞经T细胞依赖性可塑状态转变,归入肿瘤/淋巴瘤分类。数据为高通量测序的基因组结合/占据谱分析,物种为小鼠(10090),平台GPL24247,仅含1个文件GSE249081_series_matrix.txt.gz。研究关注生发中心B细胞在获得T细胞帮助后短暂获得功能可塑性(称为anaplasis)的过程,涉及B细胞程序部分沉默及胚胎干细胞超级增强子与基因再激活。该数据可用于研究B细胞表型可塑性及转录调控机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 30 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在适应性免疫应答过程中,完全成熟的生发中心(GC)B细胞表现出独特的能力,能够经历快速的多方向且剧烈的表型转变,并演化为多样的记忆细胞和抗体分泌细胞。目前已知没有其他成熟细胞谱系在生理条件下表现出如此广泛的表型可塑性。这究竟代表一种分化形式还是干细胞样可塑性的重新获得仍不清楚。在此,我们表明GC B细胞经历功能可塑性的短暂获得,这在生理条件下是前所未有的。引人注目的是,这一过程(我们称之为“anaplasis”)在空间和时间上局限于接受T细胞帮助的GC B细胞。Anaplasis涉及B细胞程序的部分沉默、胚胎干细胞超级增强子和基因的重新激活,并依赖于特定转录
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE249081
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 30 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
在适应性免疫应答过程中,完全成熟的生发中心(GC)B细胞展现出独特的能力,能够经历快速的多向性和显著的表型转变,并演化为多种记忆细胞和抗体分泌细胞。目前已知的其他成熟细胞谱系在生理条件下均未表现出如此广泛的表现型可塑性。这一现象究竟代表一种分化形式,还是干细胞样可塑性的重新获得,仍属未知。在此,我们证明GC B细胞经历了一种功能可塑性的短暂增强,这在生理条件下是前所未有的。引人注目的是,这一过程——我们称之为“去分化”(anaplasis)——在空间和时间上仅限于接受T细胞辅助的GC B细胞。去分化涉及B细胞程序的部分沉默、胚胎干细胞超级增强子和基因的重新激活,并依赖于特定的转录因子。值得注意的是,增强T细胞辅助的淋巴瘤突变进一步提高了GC干细胞样功能,而诱导染色质可塑性的突变则绕过了对T细胞的需求。此外,去分化特征与弥漫性大B细胞淋巴瘤的不良预后相关。
总之,我们的研究结果记录了分化细胞在生理条件下能够重新获得类似干细胞的可塑性。这种潜在有害的表型与严格的非细胞自主检查点共同进化,这些检查点与免疫选择过程相关。生发中心间变可能有助于解释为何大多数淋巴样恶性肿瘤起源于成熟的生发中心B细胞,并可能被劫持,导致侵袭性疾病和高适应性的淋巴瘤。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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