CARD11功能获得上调BCL2A1并促进B细胞淋巴瘤靶向联合治疗耐药 [scRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239497

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

联合靶向治疗策略在套细胞淋巴瘤（MCL）等B细胞淋巴瘤中有效，但获得性耐药仍是反复出现的问题。在此，我们对接受针对CD20、BCL2和BTK的靶向治疗（即OAsIs试验）的MCL患者进行了纵向基因组和单细胞RNA-seq整合分析。我们揭示了体内对OAsIs联合方案具有选择性优势的亚克隆的出现，并表明耐药细胞的特征是NFkB1靶基因的不依赖BCR的过表达，尤其是由CARD11突变所致。功能研究表明，CARD11功能获得不仅导致BCR非依赖性，还直接增加抗凋亡基因BCL2A1的转录，从而导致对venetoclax及OAsIs联合方案的耐药。基于OAsIs耐药亚克隆的转录谱，我们设计了一个16基因耐药特征，该特征同样可预测接受常规化疗的MCL患者，提示存在一种共同的逃逸机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。