GSE239433:活化诱导胞苷脱氨酶定义小鼠成熟Burkitt样淋巴瘤
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE239433,聚焦活化诱导胞苷脱氨酶(AID)在小鼠成熟Burkitt样淋巴瘤中的作用

基本信息
资源简介
GSE239433:活化诱导胞苷脱氨酶定义小鼠成熟Burkitt样淋巴瘤
Activation Induced Deaminase defines a mature Burkitt-like lymphoma in the mouse
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE239433,聚焦活化诱导胞苷脱氨酶(AID)在小鼠成熟Burkitt样淋巴瘤中的作用。源站描述指出生发中心是抗体二次多样化的场所,AID通过引入免疫球蛋白基因的体细胞改变触发该过程,但也可能靶向其他基因组区域导致突变和染色体易位,具有致癌潜力。许多人类淋巴瘤如弥漫性大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤和Burkitt淋巴瘤起源于经历生发中心反应的成熟B细胞并携带染色体易位。该数据包含1个文件,可用于研究AID驱动的成熟B细胞淋巴瘤发生机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):生发中心(GCs)是抗体二次多样化的场所,也是许多疫苗接种策略作用机制的基础。活化诱导胞苷脱氨酶(AID)通过引入免疫球蛋白基因的体细胞改变来触发抗体二次多样化,从而产生亲和力更高、效应功能更特化的抗体。然而,AID也可能靶向其他基因组区域,导致具有致癌潜力的突变和染色体易位。许多人类淋巴瘤起源于经历过GC反应的成熟B细胞,如弥漫性大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤和Burkitt淋巴瘤,并携带染色体易位。成熟B细胞淋巴瘤的发生已通过遗传引入染色体易位在小鼠中建模。在此,我们呈现首个深入的chara
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL17021、10090。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239433
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 07 202,引用时请注意版本时效。
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239433
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
生发中心(GCs)是次级抗体多样化的场所,也是许多疫苗接种策略作用机制的基础。活化诱导胞苷脱氨酶(AID)通过在免疫球蛋白基因中引入体细胞改变,触发次级抗体多样化,从而产生具有更高亲和力和更特化效应功能的抗体。然而,AID也可靶向其他基因组区域,引发具有致癌潜能的突变和染色体易位。许多人类淋巴瘤起源于经历生发中心反应的成熟B细胞,如弥漫性大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤和伯基特淋巴瘤,并携带染色体易位。通过遗传学方法引入染色体易位,已在小鼠中建立了成熟B细胞淋巴瘤发生模型。在此,我们首次对其中一种模型——λ-MYC小鼠——进行了深入表征。
我们发现,年轻的前肿瘤阶段小鼠在早期B细胞分化中存在显著阻滞,导致产生缺乏表面B细胞受体(BCR)表达的侵袭性极强的肿瘤,这表明λ-MYC小鼠中很大一部分肿瘤起源于B细胞前体而非成熟B细胞。此外,我们通过使用AID表达的遗传示踪技术评估了AID对λ-MYC小鼠B细胞淋巴瘤发生的贡献。仅有一部分肿瘤含有由AID表达定义的生发中心(GC)经历细胞。表达AID的肿瘤与更长的生存期相关,并类似于成熟伯基特淋巴瘤。因此,AID表达定义了λ-MYC小鼠中的伯基特淋巴瘤发生。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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