CARD11功能获得上调BCL2A1并促进B细胞淋巴瘤靶向联合治疗耐药

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239353

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数据说明

联合靶向治疗策略在套细胞淋巴瘤（MCL）等B细胞淋巴瘤中有效，但获得性耐药仍是反复出现的问题。本研究对接受针对CD20、BCL2和BTK靶向治疗（即OAsIs试验）的MCL患者进行了纵向基因组和单细胞RNA-seq整合分析。我们揭示了体内对OAsIs联合方案具有选择性优势的亚克隆的出现，并表明耐药细胞的特征是BCR非依赖性NFkB1靶基因过表达，尤其是由CARD11突变所致。功能研究证明，CARD11功能获得性突变不仅导致BCR非依赖性，还直接增加抗凋亡基因BCL2A1的转录，从而导致对venetoclax及OAsIs联合方案的耐药。基于OAsIs耐药亚克隆的转录谱，我们设计了一个16基因耐药特征谱，该特征谱对接受常规化疗的MCL患者也具有预测价值，提示存在共同的逃逸机制。在抑制CARD11依赖性NFkB1转导的可成药策略中，我们评估了对其关键伙伴MALT1的选择性抑制。

我们证明，抑制MALT1蛋白酶可导致参与OAsIs耐药的相关基因表达下调，包括BCL2A1。因此，无论在体外还是体内，MALT1抑制剂与BCL2抑制剂联合使用均能诱导协同性细胞死亡，且不受CARD11突变状态的影响。综上所述，我们的研究揭示了靶向治疗的耐药机制，并为克服侵袭性B细胞淋巴瘤的耐药性提供了一种新策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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