DMSO或MAK683处理癌细胞的H3K27me3与H3K4me3 ChIP-seq

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE232613

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

甲基转移酶多梳抑制复合物2（PRC2）由EZH2、SUZ12和EED亚基组成，通过催化组蛋白H3第27位赖氨酸残基三甲基化（H3K27me3）而与转录抑制相关。PRC2是一个经过验证的药物靶点，因为在患者样本中发现的EZH2功能获得性突变可驱动肿瘤发生。PRC2抑制剂已被发现并在临床上证明了抗癌疗效。然而，其药理学机制尚不清楚。MAK683是一种处于临床开发阶段的高效EED抑制剂。我们研究的总体目标是理解PRC2抑制后导致肿瘤消退的分子事件。我们的研究揭示了BMP-ACVR1信号通路是PRC2抑制剂抗淋巴瘤疗效的关键组成部分。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。