GSE22594:硼替佐米在原发性渗出性淋巴瘤直接异种移植模型中的疗效

源站描述显示,研究利用直接异种移植模型 UM-PEL-1 评估硼替佐米对原发性渗出性淋巴瘤的疗效,并通过基因组芯片转录组分析发现硼替佐米下调细胞周期进程、DNA 复制和 Myc 靶基因

geo
浏览 3
基因组预测Expression profiling by arrayGPL624410090
GSE22594: Efficacy of bortezomib in a direct xenograft model of primary effusion lymphoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE22594:硼替佐米在原发性渗出性淋巴瘤直接异种移植模型中的疗效

Efficacy of bortezomib in a direct xenograft model of primary effusion lymphoma

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE22594_series_matrix.txt.gz),主题为表达谱芯片分析,平台为 GPL6244,物种为 10090。源站描述显示,研究利用直接异种移植模型 UM-PEL-1 评估硼替佐米对原发性渗出性淋巴瘤的疗效,并通过基因组芯片转录组分析发现硼替佐米下调细胞周期进程、DNA 复制和 Myc 靶基因。数据可用于淋巴瘤治疗相关基因表达分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 28 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):原发性渗出性淋巴瘤是一种侵袭性 B 细胞淋巴瘤,最常见于 HIV 阳性患者,并且普遍与卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)相关。化疗对 PEL 的治疗在绝大多数患者中仅能获得短期缓解,而开发更优治疗方法的努力因缺乏能更准确模拟人类疾病的动物模型而受阻。为解决这一问题,我们通过将新鲜分离的人 PEL 细胞在不经体外培养的情况下转移至 NOD/SCID 小鼠腹腔,开发了直接异种移植模型 UM-PEL-1。我们利用该模型证明硼替佐米可诱导 PEL 缓解并延长携带淋巴瘤性积液小鼠的总生存期。基因组芯片转录组分析显示,硼替佐米下调细胞周期进程、DNA 复制和 Myc 靶基因。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL6244、10090。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE22594

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 26 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE22594

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

原发性渗出性淋巴瘤是一种侵袭性B细胞淋巴瘤,最常见于HIV阳性患者,并且普遍与卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)相关。对PEL的化疗治疗在绝大多数患者中仅能获得短期缓解,而开发更优治疗方法的努力一直受到缺乏能更准确模拟人类疾病的动物模型的阻碍。为解决这一问题,我们通过将新鲜分离的人PEL细胞直接转移至NOD/SCID小鼠腹腔内、未经体外细胞培养,建立了一种直接异种移植模型UM-PEL-1。我们利用该模型证明,硼替佐米可诱导PEL缓解,并延长携带淋巴瘤性渗出液小鼠的总生存期。通过基因组芯片进行的转录组分析显示,硼替佐米下调了细胞周期进程、DNA复制和Myc靶基因。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案