GSE195651：NR1H3（LXRα）与促炎巨噬细胞相关，预测弥漫性大B细胞淋巴瘤生存并提供新免疫调节依据

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE195651

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数据说明

巨噬细胞（Mo）在弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中的作用及其预后影响仍存在争议。通过调节脂质代谢，肝X受体（LXRs）调控Mo的极化/炎症反应，其药理学调控正处于临床研究阶段，用于治疗包括淋巴瘤在内的人类癌症。在此，我们探讨了LXRs在DLBCL中的潜在预后和治疗价值。通过比较 bulk 肿瘤与纯化的恶性和正常B细胞，我们发现编码LXR-α亚型的NR1H3与肿瘤微环境（TME）之间存在引人关注的关联。基于CIBERSORTx对大型DLBCL数据集的纯化分析显示，该受体在M1样促炎Mo中高表达。通过确定NR1H3的表达截断值，我们利用数字表达技术在两个大型独立队列（一项在研临床试验队列和一个真实世界队列）中验证了其预后判断能力。独立于经典预后因素，NR1H3高表达患者相比NR1H3低表达病例显示出更长的生存期，且高分辨率Mo基因表达谱（GEP）剖析提示亚组之间存在显著的转录差异。

最后，我们用一种新型口服LXR激动剂处理体外生成的M2型单核细胞（Mo），这些细胞基础NR1H3表达较低，观察到NR1H3及炎症基因显著上调。总体而言，我们的研究结果表明NR1H3可作为DLBCL中单核细胞的生物标志物，有助于识别处于不同风险及具有异质性肿瘤微环境（TME）的患者，这些患者可能从DLBCL中针对单核细胞的免疫调节治疗中获益。来自ThP1细胞体外生成巨噬细胞的表达数据，这些巨噬细胞分别经DMSO或RGX104处理。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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