SOX9-DHCR24-胆固醇生物合成轴在IGH-BCL2阳性弥漫性大B细胞淋巴瘤中的致癌作用[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE180051

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数据说明

尽管干细胞调控因子SOX9的致癌性已在许多实体瘤中被提及，但其在淋巴瘤发生中的作用仍 largely 未知。在本研究中，我们发现SOX9在携带IGH-BCL2易位的弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的一个亚群中优先过表达。DLBCL中SOX9阳性与疾病晚期相关。沉默SOX9可降低细胞增殖、诱导G1/S期阻滞并增加DLBCL细胞的凋亡，无论在体外还是体内均如此。全转录组分析和CHIP-seq实验确定DHCR24——胆固醇生物合成中的末端酶——为SOX9的直接靶标，SOX9通过增加DHCR24表达促进胆固醇合成。强制表达DHCR24能够挽救DLBCL细胞中与SOX9敲低相关的表型。在DLBCL细胞系异种移植模型中，SOX9敲低导致DHCR24水平降低、胆固醇含量减少和肿瘤负荷下降。

药物抑制胆固醇合成同样抑制了DLBCL异种移植瘤的发生，且在SOX9表达较高的DLBCL细胞系中，这种抑制作用更为明显，提示该细胞系可能对胆固醇存在依赖性。综上所述，我们的研究表明SOX9可通过DHCR24及胆固醇生物合成途径驱动淋巴瘤发生。这一SOX9-DHCR24-胆固醇生物合成轴或可作为DLBCL的新型治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。