GSE160276：B细胞转录因子PAX5在原发性渗出性淋巴瘤中通过调控细胞周期发挥抑癌作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE160276

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数据说明

原发性渗出性淋巴瘤（PEL）是一种由卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）/人疱疹病毒8型（HHV-8）感染引起的侵袭性B细胞淋巴瘤。PEL表现出侵袭性行为，导致体腔积液而无明显的实体肿瘤。PEL患者的典型预后和临床病程较差，具有潜在致死性。迫切需要阐明PEL的致病机制，以开发新的治疗方法。PEL细胞通常缺乏B细胞表面标志物如CD19，因此我们假设B细胞转录因子PAX5在PEL中下调。PAX5从前B细胞到成熟B细胞阶段表达，对B细胞的分化不可或缺。PAX5在PEL细胞中通过PAX5启动子区域的甲基化而沉默。PAX5的上调诱导了多个编码B细胞表面标志物mRNA的基因，但未影响蛋白质水平。PAX5通过G1细胞周期阻滞抑制细胞生长。PAX5与RB结合并增加其蛋白质表达。在微阵列分析和PCR实验中，RB/E2F调控的基因显著下调。

为阐明PAX5的体内功能，我们在使用严重免疫缺陷的NOD/SCID/Jak3缺陷（NOJ）小鼠建立的PEL异种移植模型中，分析了PAX5的恢复情况。PAX5的恢复显著抑制了腹水量和器官侵袭。PAX5的减少在PEL的肿瘤发生中起关键作用，且PAX5在PEL中是一种肿瘤抑制因子。靶向PAX5可能为PEL患者提供一种新的治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。