GSE153716：TMBIM6/BI-1通过组装mTORC2和激活AKT促进癌症进展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE153716

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

跨膜B细胞淋巴瘤2相关X蛋白抑制剂基序包含蛋白(TMBIM)6是一种类Ca2+通道蛋白，在多种癌症类型中高度上调。在此，我们证明TMBIM6与宫颈癌、乳腺癌、肺癌和前列腺癌患者的生存密切相关。TMBIM6缺失或敲低可抑制原发肿瘤生长。此外，TMBIM6上调了mTORC2的活化，并刺激了糖酵解、蛋白质合成以及脂质合成基因和糖基化蛋白的表达。而且，TMBIM6特有的内质网渗漏性Ca2+被证明可影响mTORC2组装及其与核糖体的结合。此外，我们发现BIA化合物——一种提示性的TMBIM6拮抗剂——可阻止TMBIM6与mTORC2结合，降低mTORC2活性，并调控TMBIM6渗漏性Ca2+，从而在癌症异种移植模型中进一步抑制肿瘤形成和进展。这一此前未知的信号级联——其中mTORC2活性通过与TMBIM6的相互作用而增强——为多种恶性肿瘤提供了有效的治疗靶点。

我们使用微阵列详细分析了基因表达的全局情况，并发现，在TMBIM6敲除的HT1080细胞中，与凋亡过程、迁移、增殖及代谢途径相关的大多数差异表达基因均有所减少。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。