EZH2抑制联合Ikaros降解在生发中心B细胞弥漫大B细胞淋巴瘤中的协同效应[ChIP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE152028

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为探索提高EZH2抑制剂治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)临床疗效的治疗机会，在tazemetostat存在下进行了全基因组药物增敏CRISPR/Cas9筛选。我们发现IKZF1或IKZF3的缺失增强了tazemetostat对DLBCL的效力。用来那度胺(一种降解IKZF1和IKZF3的免疫调节药物)与tazemetostat联合处理细胞，重现了药物增敏筛选中观察到的效果。联合药物治疗在更广泛的DLBCL细胞系中显示出更高的协同效应，通过触发细胞周期阻滞或凋亡，无论EZH2突变状态如何。RNAseq分析显示干扰素信号和抗病毒免疫应答特征强烈上调。在来那度胺和tazemetostat处理的细胞中，IRF7和DDX58等关键因子的基因表达被高度诱导，同时ChIPseq和ChIP qPCR分析显示其启动子处H3K27乙酰化富集。

此外，转录组分析和免疫荧光染色显示，多种内源性逆转录病毒（ERVs）显著表达，且上调的ERV位点与EZH2突变淋巴瘤细胞系中明确的H3K27me3富集区域存在显著重叠。我们的数据强调了来那度胺与tazemetostat在调节表观遗传变化方面的协同相互作用，导致干扰素反应上调及ERVs去抑制，最终减缓GCB型DLBCL的生长。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。