P3HR-1细胞表达对照、smc1a、supt16h、med12或tada2b sgRNA及Akata EBV阳性细胞表达对照或myc sgRNA的转录组分析
研究通过全基因组CRISPR筛选发现以MYC为中心、包含cohesins、FACT、STAGA和Mediator的宿主因子网络抑制EBV裂解再激活，并利用RNAseq鉴定宿主和病毒转录组变化
基本信息
资源简介
P3HR-1细胞表达对照、smc1a、supt16h、med12或tada2b sgRNA及Akata EBV阳性细胞表达对照或myc sgRNA的转录组分析
Transcriptome analysis of P3HR-1 cells expressing control, smc1a, supt16h, med12, or tada2b sgRNAs and Akata EBV+ cells expressing control or myc sgRNAs
该数据集来自NCBI GEO，包含P3HR-1 Burkitt淋巴瘤细胞表达control、smc1a、supt16h、med12或tada2b sgRNA，以及Akata EBV+ Burkitt淋巴瘤细胞表达control或myc sgRNA后的转录组测序数据。研究通过全基因组CRISPR筛选发现以MYC为中心、包含cohesins、FACT、STAGA和Mediator的宿主因子网络抑制EBV裂解再激活，并利用RNAseq鉴定宿主和病毒转录组变化。数据可用于分析EBV潜伏维持相关宿主因子对基因表达的影响（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 19 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为了深入了解EBV潜伏期是如何维持的，我们在潜伏感染EBV的Burkitt淋巴瘤B细胞中进行了人类全基因组CRISPR筛选。我们的分析鉴定出一个抑制EBV裂解再激活的宿主因子网络，该网络以转录因子MYC为中心，并包括cohesins、FACT、STAGA和Mediator。RNAseq用于鉴定表达control、smc1a、supt16h、med12或tada2b sgRNA的P3HR-1 Burkitt淋巴瘤细胞中宿主和病毒转录组的变化。RNAseq用于鉴定表达control或myc sgRNA的Akata EBV+ Burkitt淋巴瘤细胞中宿主和病毒转录组的变化。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL18573、9606。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE140651
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 15 202，引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
为深入了解EBV潜伏状态是如何维持的，我们在潜伏感染EBV的伯基特淋巴瘤B细胞中进行了全人类基因组CRISPR筛选。我们的分析鉴定出一个抑制EBV裂解性再激活的宿主因子网络，该网络以转录因子MYC为核心，并包括cohesin、FACT、STAGA和Mediator。我们使用RNAseq鉴定了表达对照、smc1a、supt16h、med12或tada2b sgRNA的P3HR-1伯基特淋巴瘤细胞中宿主和病毒转录组的变化。我们使用RNAseq鉴定了表达对照或myc sgRNA的Akata EBV阳性伯基特淋巴瘤细胞中宿主和病毒转录组的变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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