EBV抑制剂应答的细胞转录组变化

该数据集来自 NCBI GEO(GSE135794),研究 Burkitt 淋巴瘤细胞在 Epstein-Barr 病毒(EBV)裂解周期激活剂与抑制剂处理下的细胞转录组变化

geo
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基因组预测GPL111549606
GSE135794: Changes in cellular transcriptome in response to inhibitors of Epstein-Barr virus

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

EBV抑制剂应答的细胞转录组变化

Changes in cellular transcriptome in response to inhibitors of Epstein-Barr virus

该数据集来自 NCBI GEO(GSE135794),研究 Burkitt 淋巴瘤细胞在 Epstein-Barr 病毒(EBV)裂解周期激活剂与抑制剂处理下的细胞转录组变化。数据通过高通量测序进行表达谱分析,包含 1 个文件(GSE135794_series_matrix.txt.gz),物种为人类(9606),平台为 GPL11154。可用于识别调控 EBV 裂解周期的潜在细胞基因,并支持病毒-宿主相互作用及淋巴瘤相关转录调控研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 13 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Burkitt 淋巴瘤细胞可被 Epstein-Barr 病毒(EBV)潜伏感染。该病毒可被小分子(如丁酸钠)激活进入裂解周期。其他分子(如丙戊酸盐和丙戊酰胺)则阻断病毒裂解再激活。这些药理制剂改变控制病毒裂解基因表达的细胞生理状态。为识别病毒生命周期潜在调控因子的细胞基因,测量了细胞转录在响应 EBV 裂解周期一种激活剂和两种抑制剂时的变化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE135794

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 18 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

伯基特淋巴瘤细胞可潜伏感染EB病毒(EBV)。该病毒可被小分子化合物(如丁酸钠)激活进入裂解周期。其他分子(如丙戊酸盐和丙戊酰胺)则阻断病毒的裂解性再激活。这些药物制剂改变控制病毒裂解基因表达的细胞生理状态。为鉴定潜在调控病毒生命周期的细胞基因,研究人员测量了EB病毒裂解周期的一种激活剂和两种抑制剂引起的细胞转录变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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