髓系特异性Beclin-1敲除小鼠B细胞淋巴瘤转录组差异表达基因分析
该数据集来自NCBI GEO（GSE132899），对髓系特异性Beclin-1敲除（Becn1ΔM）小鼠自发性B细胞淋巴瘤的颈部淋巴结肿瘤组织与野生型（WT）颈部淋巴结对照进行RNA-seq转录组分析，用于鉴定差异表达基因
基本信息
资源简介
髓系特异性Beclin-1敲除小鼠B细胞淋巴瘤转录组差异表达基因分析
Transcriptome analysis of differential expressed genes in B cell lymphomas from myeloid-specific Beclin-1 (Becn1ΔM) KO mice compared to (wild type) WT cervical lymph node controls.
该数据集来自NCBI GEO（GSE132899），对髓系特异性Beclin-1敲除（Becn1ΔM）小鼠自发性B细胞淋巴瘤的颈部淋巴结肿瘤组织与野生型（WT）颈部淋巴结对照进行RNA-seq转录组分析，用于鉴定差异表达基因。数据包含1个文件（GSE132899_series_matrix.txt.gz），主题标签涉及高通量测序表达谱分析，物种为小鼠（10090），平台为GPL18635。该数据可用于研究Becn1缺失相关B细胞淋巴瘤的基因表达特征，包括炎症与B细胞刺激相关分子上调、白细胞跨内皮迁移相关细胞连接分子下调等生物学过程（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jun 18 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们报道髓系缺陷Becn1（Becn1ΔM）小鼠会自发产生B细胞淋巴瘤。为确定该肿瘤的基因表达谱，我们从颈部淋巴结肿瘤中提取总RNA进行RNA-seq，发现编码炎症和B细胞刺激分子的基因上调，以及与白细胞跨内皮迁移相关的细胞连接分子下调。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL18635、10090。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE132899
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 31 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们报告，髓系缺陷型Becn1（Becn1ΔM）小鼠会自发发展为B细胞淋巴瘤。为了确定肿瘤的基因表达谱，我们从颈部淋巴结肿瘤中提取总RNA进行RNA-seq分析，发现编码炎症和B细胞刺激分子的基因表达上调，而与白细胞跨内皮迁移相关的细胞连接分子表达下调。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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