GSE115136：下一代测序助力分析PRMT5在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的作用

资源简介

GSE115136：下一代测序助力分析PRMT5在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的作用

GSE115136 数据集来自 NCBI GEO，围绕弥漫性大 B 细胞淋巴瘤（DLBCL）中 PRMT5 的作用展开，采用高通量测序对 PRMT5 敲除与未敲除的 DLBCL 细胞进行全转录组表达谱分析。该数据集以单个压缩的表达谱矩阵文件提供，可用于考察 PRMT5 调控的下游基因表达变化及相关通路。整体而言，它属于肿瘤/淋巴瘤方向的表达谱数据资源，适合关注 DLBCL 分子机制与 PRMT5 功能的研究者使用。

【数据集背景】

弥漫性大 B 细胞淋巴瘤（DLBCL）是淋巴瘤中的常见类型，其发生发展涉及复杂的基因表达调控。PRMT5 是一种蛋白精氨酸甲基转移酶，在多种肿瘤中参与调控细胞存活相关通路。该数据集的研究目标即借助下一代测序技术，分析 PRMT5 在 DLBCL 细胞中的作用，通过比较 PRMT5 敲除与未敲除细胞的转录组差异，揭示受 PRMT5 调控的重要促存活通路。

【数据内容】

该数据集提供的是 DLBCL 细胞在 PRMT5 敲除与未敲除条件下的全转录组表达谱数据，通过高通量测序获取。数据以表达谱矩阵形式组织，文件数量为 1，样例文件名为 GSE115136_series_matrix.txt.gz。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL16791 和 9606，分别指向高通量测序表达谱、所用平台以及人类物种信息。数据内容聚焦于基因表达层面的整体变化，而非基因组变异或蛋白层面信息。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov（NCBI GEO），源站标题为“Next generation sequencing facilitates analysis of the role of PRMT5 in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL)”。源站描述指出，对有无 PRMT5 敲除的 DLBCL 细胞进行全转录组分析，揭示了受 PRMT5 调控的重要促存活通路。数据集作者为 Lixin、Rui，发布时间为 May 30 201。本站将其归类为肿瘤 / 淋巴瘤。

【适用场景】

该数据集适用于研究 DLBCL 中 PRMT5 的转录调控功能，例如比较 PRMT5 敲除与对照细胞的基因表达差异、识别受 PRMT5 影响的促存活通路，以及作为淋巴瘤表达谱研究的参考数据。也可用于高通量测序表达谱分析方法的教学与流程验证。具体实验设计细节、样本数量与分组信息源站未提供。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE115136_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于该文件为表达谱矩阵，分析前应明确行与列对应的基因和样本信息；源站未提供更详细的分析步骤说明。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，数据规模有限；样本组成、测序深度、重复设置及质控指标等信息源站未提供。使用时应注意其来源于公共数据库，需结合具体研究目的判断适用性。发布时间字段在源站信息中显示为“May 30 201”，年份信息不完整，源站未提供更明确的说明。

【引用与许可】

引用该数据集时应参考 NCBI GEO 的相应要求，并注明数据集编号 GSE115136 及作者 Lixin、Rui。具体许可条款与使用限制源站未提供。