人类淋巴瘤细胞系RNA-seq数据

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人类淋巴瘤细胞系RNA-seq数据

GSE114265 是一个来自 NCBI 的 RNA-seq 数据集，全称为 RNA-seq data from human lymphoma cell lines，即人类淋巴瘤细胞系的 RNA-seq 数据。该数据集聚焦于肿瘤领域的淋巴瘤研究，围绕人类淋巴瘤细胞系 OCI-Ly19 展开，比较了 EZH2 野生型细胞系（LY19WT）与表达突变蛋白 EZH2-Y646F 的同源细胞系（LY19Y646F）两种条件下的转录组变化。数据集由 Maria C Donaldson 提交，发布时间为 2019 年 5 月 9 日，主题标签涉及高通量测序表达谱分析，平台编号为 GPL18573，物种编号为 9606（即人类）。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE114265_series_matrix.txt.gz，属于肿瘤/淋巴瘤分类，适合用于研究 EZH2 突变相关的基因表达差异。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为 RNA-seq data from human lymphoma cell lines。研究背景建立在人类淋巴瘤细胞系 OCI-Ly19 之上，通过对比 EZH2 野生型细胞系（LY19WT）与表达突变蛋白 EZH2-Y646F 的同源细胞系（LY19Y646F），考察两种条件之间的转录组变化。EZH2 是表观遗传调控相关的重要基因，其突变状态可能影响细胞的基因表达格局，因此该数据集为理解淋巴瘤细胞中 EZH2 突变所带来的转录组层面差异提供了直接的测序数据基础。

【数据内容】

数据集的核心内容是针对上述两种细胞系条件开展的 RNA-seq 实验所产生的表达谱数据。数据以高通量测序方式获得，主题归类为 Expression profiling by high throughput sequencing。整个数据集仅包含 1 个文件，即 GSE114265_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件，通常用于汇总样本层面的表达信息。数据涉及人类（物种编号 9606）淋巴瘤细胞系，平台信息标注为 GPL18573。数据所覆盖的生物学比较为 LY19WT 与 LY19Y646F 两种条件之间的转录组差异。

【采集与来源】

数据采集自人类淋巴瘤细胞系 OCI-Ly19 的 RNA-seq 实验，实验设计包括 EZH2 野生型细胞系（LY19WT）和表达突变蛋白 EZH2-Y646F 的同源细胞系（LY19Y646F）两种条件。数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，提交者为 Maria C Donaldson，发布时间为 2019 年 5 月 9 日。关于样本的具体培养条件、测序平台仪器型号、测序读长与深度、生物学重复数量等实验细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤尤其是淋巴瘤方向的转录组研究，可用于比较 EZH2 野生型与 EZH2-Y646F 突变型淋巴瘤细胞系之间的基因表达差异，辅助探索 EZH2 突变对转录组的影响。由于数据属于高通量测序表达谱，也可用于表达谱分析方法的验证、差异表达分析流程的测试，以及作为淋巴瘤细胞系转录组研究的参考数据。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE114265_series_matrix.txt.gz，按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。关于具体的分析步骤、标准化方法或推荐软件，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，数据规模相对有限。关于测序质量、重复性、批次效应以及数据完整性等质量指标，源站未提供。使用时应注意数据集仅涉及 OCI-Ly19 一种细胞系的两种条件，其结果的外推范围受限于源站描述所界定的实验设计。

【引用与许可】

数据提交者为 Maria C Donaldson，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的正式引用格式与使用许可条款，源站未提供。